More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2647 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  75.97 
 
 		 1550 aa  1401    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  75.19 
 
 		 1547 aa  1413    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  99 
 
 		 1527 aa  1816    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  49.13 
 
 		 1560 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 934 aa  1912    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  76.2 
 
 		 1520 aa  1428    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  99.89 
 
 		 1551 aa  1834    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  40.72 
 
 		 1573 aa  633  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  38.15 
 
 		 1609 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  30.61 
 
 		 1626 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  35.3 
 
 		 1981 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1620 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  35.57 
 
 		 1429 aa  319  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  34.81 
 
 		 1586 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  30.76 
 
 		 1554 aa  250  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  29.37 
 
 		 1579 aa  233  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  29.37 
 
 		 1428 aa  233  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  31.17 
 
 		 1485 aa  232  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  31.6 
 
 		 1446 aa  229  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  34.46 
 
 		 1602 aa  224  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  32.27 
 
 		 1421 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1411 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  30.14 
 
 		 1386 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1197 aa  213  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  29.88 
 
 		 855 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  32.99 
 
 		 1362 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.97 
 
 		 1568 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  29.06 
 
 		 1385 aa  209  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  28.69 
 
 		 1140 aa  209  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1409 aa  207  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1229 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  28.81 
 
 		 1401 aa  204  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1400 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1654 aa  201  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1565 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1565 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  30.63 
 
 		 2277 aa  197  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1611 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  28.21 
 
 		 1508 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  31.22 
 
 		 613 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  29.22 
 
 		 1434 aa  192  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1418 aa  192  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1466 aa  191  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.9 
 
 		 1586 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1492 aa  189  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.3 
 
 		 1595 aa  187  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1390 aa  187  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  27.41 
 
 		 1518 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1402 aa  186  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  39.56 
 
 		 422 aa  183  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  28.22 
 
 		 1530 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  27.48 
 
 		 1259 aa  182  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1368 aa  181  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1604 aa  179  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  29.48 
 
 		 2035 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.26 
 
 		 1348 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.9 
 
 		 1271 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  29.42 
 
 		 1488 aa  175  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  27.6 
 
 		 1593 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1583 aa  173  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1531 aa  172  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.31 
 
 		 1543 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.31 
 
 		 1552 aa  171  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1419 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.28 
 
 		 1576 aa  168  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1699 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  34.89 
 
 		 924 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.91 
 
 		 3027 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.86 
 
 		 1614 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1410 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2612  YD repeat-containing protein  31.23 
 
 		 497 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.68 
 
 		 1572 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1317 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.59 
 
 		 2096 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.47 
 
 		 2149 aa  163  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  26.21 
 
 		 1384 aa  162  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1319 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  27.39 
 
 		 2144 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25 
 
 		 1539 aa  160  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1541 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1541 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1541 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  25.27 
 
 		 1495 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1381 aa  157  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1541 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1541 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1541 aa  155  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  25 
 
 		 1539 aa  154  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  39.33 
 
 		 867 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  36.04 
 
 		 866 aa  153  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  28.27 
 
 		 1494 aa  153  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  28.27 
 
 		 1494 aa  153  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1352 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  24.79 
 
 		 1359 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.96 
 
 		 1528 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  28.01 
 
 		 1379 aa  147  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.37 
 
 		 1509 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.93 
 
 		 1517 aa  144  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  30.53 
 
 		 1410 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>