107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1247 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 871 aa  1664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 884 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 880 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  31.35 
 
 		 865 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 884 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  35.5 
 
 		 868 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 879 aa  144  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  29.74 
 
 		 864 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  31.14 
 
 		 562 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 907 aa  103  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  31.61 
 
 		 893 aa  93.6  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  36.73 
 
 		 867 aa  93.6  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  27.94 
 
 		 908 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 845 aa  80.1  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 926 aa  79.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 893 aa  76.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.64 
 
 		 1139 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 1118 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 1141 aa  68.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 1141 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 894 aa  67.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 1141 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  38.18 
 
 		 660 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  39.01 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  27.67 
 
 		 916 aa  62  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  25.74 
 
 		 912 aa  60.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.33 
 
 		 881 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  26.61 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  27.08 
 
 		 903 aa  58.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  28.61 
 
 		 1001 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  29.35 
 
 		 862 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 910 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.46 
 
 		 218 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  28.67 
 
 		 977 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0376  two component LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 240 aa  54.3  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.85 
 
 		 1053 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 1198 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 876 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 1141 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 907 aa  52.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.06 
 
 		 1123 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  23.85 
 
 		 2312 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 1148 aa  52  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 214 aa  52  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  29.9 
 
 		 1123 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 201 aa  51.6  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.12 
 
 		 900 aa  51.2  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  25.77 
 
 		 292 aa  51.2  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  57.63 
 
 		 907 aa  50.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 201 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 231 aa  50.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.42 
 
 		 215 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  23.65 
 
 		 1264 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  49.3  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  45.76 
 
 		 217 aa  49.3  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  26.79 
 
 		 929 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 929 aa  48.5  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  29.89 
 
 		 690 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  29.89 
 
 		 690 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  29.89 
 
 		 690 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 1089 aa  48.5  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  28 
 
 		 1118 aa  48.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  44.87 
 
 		 954 aa  47.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  30.77 
 
 		 393 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 		 1046 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 938 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.19 
 
 		 1050 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.19 
 
 		 1050 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 217 aa  47  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 209 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1239  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 196 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0482404  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 203 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 216 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0901  two component response regulator  53.33 
 
 		 196 aa  45.8  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 856 aa  46.2  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  40.22 
 
 		 955 aa  46.2  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4702  XRE family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 945 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05830  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.36 
 
 		 238 aa  46.2  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.388223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1823  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 846 aa  46.2  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 228 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 205 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 1104 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 974 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 		 1398 aa  45.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  24.94 
 
 		 1022 aa  45.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  41.56 
 
 		 957 aa  45.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2686  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 203 aa  45.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44 
 
 		 215 aa  45.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.34 
 
 		 1150 aa  45.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 881 aa  44.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 200 aa  45.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  26.8 
 
 		 1013 aa  44.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 920 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  54.76 
 
 		 91 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 201 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.35 
 
 		 213 aa  44.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  54.76 
 
 		 90 aa  44.3  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 214 aa  44.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>