More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2686 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  62.97 
 
 		 853 aa  1073    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  51.39 
 
 		 850 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  65.61 
 
 		 1063 aa  1101    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  53.27 
 
 		 957 aa  922    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  65.73 
 
 		 1063 aa  1100    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  52.61 
 
 		 843 aa  813    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  40.69 
 
 		 958 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  92.25 
 
 		 895 aa  1699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  51.52 
 
 		 843 aa  803    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  65.41 
 
 		 730 aa  953    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  61.14 
 
 		 852 aa  1030    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  65.61 
 
 		 1057 aa  1134    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  62.23 
 
 		 1074 aa  1114    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  62.45 
 
 		 892 aa  1057    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  61.44 
 
 		 923 aa  1069    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  45.25 
 
 		 890 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  65.61 
 
 		 1059 aa  1098    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  45.4 
 
 		 910 aa  758    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  61.52 
 
 		 853 aa  1036    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  44.06 
 
 		 961 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  47.87 
 
 		 780 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  47.87 
 
 		 780 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  96.86 
 
 		 895 aa  1766    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  63.09 
 
 		 853 aa  1077    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  92.58 
 
 		 895 aa  1702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  63.88 
 
 		 850 aa  1076    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  51.15 
 
 		 850 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  44.39 
 
 		 869 aa  687    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  44.88 
 
 		 875 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  45.71 
 
 		 871 aa  695    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  62.59 
 
 		 868 aa  1050    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  92.47 
 
 		 895 aa  1699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  60.64 
 
 		 847 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  65.49 
 
 		 1063 aa  1100    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  51.15 
 
 		 850 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  46.84 
 
 		 855 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  62.33 
 
 		 1057 aa  1110    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  46.22 
 
 		 835 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 891 aa  1843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  40.7 
 
 		 928 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  44.63 
 
 		 784 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 		 912 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  31.02 
 
 		 911 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  31.97 
 
 		 851 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  31 
 
 		 853 aa  361  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  30.86 
 
 		 918 aa  352  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  30.3 
 
 		 898 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  31.07 
 
 		 886 aa  347  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  28.9 
 
 		 1094 aa  337  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  31.6 
 
 		 975 aa  330  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 		 933 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  30.73 
 
 		 906 aa  323  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  30.58 
 
 		 906 aa  321  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.09 
 
 		 968 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  29 
 
 		 901 aa  306  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  29.38 
 
 		 1048 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 		 979 aa  292  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  30.58 
 
 		 845 aa  290  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  29.19 
 
 		 845 aa  289  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  32.12 
 
 		 616 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1019 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1019 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  27.61 
 
 		 920 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  28.03 
 
 		 885 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  28.45 
 
 		 928 aa  284  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  29.61 
 
 		 843 aa  283  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  28.91 
 
 		 847 aa  283  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.04 
 
 		 842 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  30.16 
 
 		 834 aa  281  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  30.04 
 
 		 834 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  28.27 
 
 		 1284 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 		 920 aa  279  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  30.04 
 
 		 834 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  30.57 
 
 		 822 aa  277  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.35 
 
 		 920 aa  276  9e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  28.15 
 
 		 837 aa  273  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  28.41 
 
 		 1284 aa  270  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  31.62 
 
 		 618 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  32.28 
 
 		 613 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  27.97 
 
 		 918 aa  267  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  27.43 
 
 		 1006 aa  265  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 661 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 661 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 661 aa  265  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.96 
 
 		 1114 aa  265  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 661 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 661 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 661 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 661 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  31.03 
 
 		 618 aa  264  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  27.45 
 
 		 862 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  31.34 
 
 		 614 aa  260  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  31.26 
 
 		 661 aa  260  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  28.54 
 
 		 952 aa  259  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  27.34 
 
 		 862 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 902 aa  257  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  26.86 
 
 		 924 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  32.18 
 
 		 703 aa  255  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  29.62 
 
 		 811 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  27.78 
 
 		 962 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>