114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3036 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  53.85 
 
 		 1028 aa  896    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 995 aa  1963    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.37 
 
 		 868 aa  239  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  30.1 
 
 		 1234 aa  231  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  28.48 
 
 		 1594 aa  215  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.48 
 
 		 1579 aa  214  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  27.7 
 
 		 773 aa  205  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  25.54 
 
 		 955 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  25.97 
 
 		 955 aa  198  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  31.01 
 
 		 1327 aa  196  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  32.35 
 
 		 1327 aa  195  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  32 
 
 		 1349 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1165 aa  190  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1165 aa  190  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.35 
 
 		 1327 aa  189  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  30.22 
 
 		 2637 aa  189  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  29.49 
 
 		 1806 aa  188  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.92 
 
 		 2057 aa  184  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  29.73 
 
 		 3322 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  29.86 
 
 		 466 aa  181  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  30.9 
 
 		 1770 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  32.11 
 
 		 989 aa  174  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.85 
 
 		 1086 aa  171  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  30.02 
 
 		 1753 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  30.99 
 
 		 1770 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.29 
 
 		 1040 aa  164  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  28.57 
 
 		 4391 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  28.34 
 
 		 4312 aa  163  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  30.09 
 
 		 1763 aa  162  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  30.22 
 
 		 1762 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  30.22 
 
 		 1762 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  30.32 
 
 		 1748 aa  160  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.55 
 
 		 806 aa  160  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  29.95 
 
 		 947 aa  157  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  26.09 
 
 		 1102 aa  157  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  31.18 
 
 		 1277 aa  145  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.06 
 
 		 1070 aa  137  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.74 
 
 		 1070 aa  137  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  24.87 
 
 		 1067 aa  134  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  28.8 
 
 		 825 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  28.35 
 
 		 818 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  28.05 
 
 		 819 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  25.64 
 
 		 1008 aa  117  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.85 
 
 		 1023 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  23.97 
 
 		 997 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  23.76 
 
 		 1004 aa  115  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.48 
 
 		 1234 aa  110  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  27.48 
 
 		 1250 aa  110  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  26.95 
 
 		 1250 aa  107  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  27.07 
 
 		 1234 aa  107  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  26.54 
 
 		 1234 aa  106  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  29.34 
 
 		 1099 aa  106  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  27.86 
 
 		 338 aa  103  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  30.84 
 
 		 1626 aa  103  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  29.77 
 
 		 950 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  27.92 
 
 		 506 aa  100  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  27.92 
 
 		 506 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  28.21 
 
 		 306 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  37.02 
 
 		 1049 aa  94.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  28.57 
 
 		 1093 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 1093 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  29.4 
 
 		 1113 aa  88.6  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.1 
 
 		 3420 aa  84.7  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  28.91 
 
 		 3415 aa  84.7  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  26.33 
 
 		 909 aa  84  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  36.06 
 
 		 914 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  39.49 
 
 		 1571 aa  83.2  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  26.65 
 
 		 2578 aa  83.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  27.45 
 
 		 1861 aa  83.2  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.11 
 
 		 1357 aa  82.4  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  26.4 
 
 		 2906 aa  82  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  30.8 
 
 		 861 aa  81.6  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.14 
 
 		 1741 aa  79  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  26.11 
 
 		 1254 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  42.4 
 
 		 924 aa  77  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.91 
 
 		 1115 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  36.53 
 
 		 927 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  26.73 
 
 		 1252 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  23.48 
 
 		 729 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  24.44 
 
 		 773 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  32.38 
 
 		 2926 aa  73.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 1108 aa  73.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  35.48 
 
 		 1012 aa  69.7  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  25.29 
 
 		 730 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  26.6 
 
 		 1593 aa  64.3  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  27.09 
 
 		 864 aa  62  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  27.46 
 
 		 1259 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  27.46 
 
 		 1285 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 		 1269 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  22.76 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 		 1268 aa  60.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  24.02 
 
 		 733 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  23.47 
 
 		 732 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.46 
 
 		 1259 aa  59.7  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 		 1254 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.74 
 
 		 1122 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  27.83 
 
 		 949 aa  57  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0823  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.29 
 
 		 855 aa  57  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  23.48 
 
 		 955 aa  55.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  26.42 
 
 		 1068 aa  55.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>