65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2347 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  45.24 
 
 
935 aa  782    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  40.65 
 
 
895 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  45.08 
 
 
941 aa  800    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  40.07 
 
 
899 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  100 
 
 
860 aa  1791    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  45.38 
 
 
904 aa  751    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  45.17 
 
 
909 aa  752    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  45.35 
 
 
918 aa  779    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  97.21 
 
 
860 aa  1742    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  90.23 
 
 
860 aa  1626    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  95.58 
 
 
860 aa  1717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  35.99 
 
 
941 aa  613  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  35.84 
 
 
931 aa  593  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  34.38 
 
 
880 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  34.59 
 
 
844 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  34.91 
 
 
951 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  32.66 
 
 
901 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  33.06 
 
 
859 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  33.46 
 
 
971 aa  517  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  34.91 
 
 
1507 aa  508  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  33.37 
 
 
872 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  35.75 
 
 
829 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  32.67 
 
 
855 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  35.19 
 
 
851 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  33.18 
 
 
1429 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  33.65 
 
 
832 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  32.21 
 
 
905 aa  479  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  36.04 
 
 
776 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  34.07 
 
 
868 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  33 
 
 
916 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  33.92 
 
 
763 aa  472  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35.51 
 
 
773 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  33.65 
 
 
894 aa  463  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  33.6 
 
 
757 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  33.97 
 
 
858 aa  462  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  30.49 
 
 
910 aa  462  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  34.36 
 
 
876 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  32.75 
 
 
910 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  33.03 
 
 
1251 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  34.08 
 
 
1061 aa  449  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  34.2 
 
 
776 aa  449  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  34.37 
 
 
774 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  31.17 
 
 
916 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  30.34 
 
 
873 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  33.98 
 
 
1084 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  31.11 
 
 
923 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  29.92 
 
 
926 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  29.39 
 
 
1107 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  30.89 
 
 
774 aa  354  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  24.37 
 
 
882 aa  239  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.61 
 
 
914 aa  234  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  24.41 
 
 
761 aa  208  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  22.89 
 
 
910 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  24.01 
 
 
757 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  23.72 
 
 
733 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.18 
 
 
728 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  20.63 
 
 
1187 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  19.03 
 
 
1188 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  19.66 
 
 
1118 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  29.37 
 
 
955 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  19.55 
 
 
793 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  21.52 
 
 
755 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0966  hypothetical protein  35.71 
 
 
691 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  19.64 
 
 
856 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  20.5 
 
 
770 aa  44.3  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>