94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6757 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  100 
 
 		 618 aa  1247    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  32.89 
 
 		 566 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  33.83 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  35.79 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  32.4 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  25.22 
 
 		 687 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  29.42 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  26.51 
 
 		 566 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  27.39 
 
 		 509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  25.97 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  32.12 
 
 		 588 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  26.45 
 
 		 533 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  26.77 
 
 		 563 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  28.49 
 
 		 386 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  26.14 
 
 		 605 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  25.26 
 
 		 564 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  30.13 
 
 		 593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  27.6 
 
 		 436 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  26.03 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  25.98 
 
 		 649 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  23.14 
 
 		 430 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  27.95 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 538 aa  104  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  28.34 
 
 		 441 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  27.8 
 
 		 434 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  28.2 
 
 		 662 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  28.34 
 
 		 616 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  32.52 
 
 		 588 aa  94  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  24.92 
 
 		 646 aa  92  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  21.71 
 
 		 559 aa  90.9  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  28.66 
 
 		 550 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  27.46 
 
 		 381 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  26.41 
 
 		 589 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  25.85 
 
 		 635 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.5 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  26.7 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  26.55 
 
 		 529 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  24.71 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  25.22 
 
 		 564 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  26.67 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  27.2 
 
 		 568 aa  78.2  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  28.5 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  24.54 
 
 		 498 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  28.5 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  27.32 
 
 		 651 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  26.43 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  26.3 
 
 		 602 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  29.59 
 
 		 602 aa  73.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  23.9 
 
 		 565 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  31.98 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  26.47 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  26.79 
 
 		 587 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  27.5 
 
 		 358 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  22.9 
 
 		 651 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  28.12 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  23.22 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 582 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  28.15 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  30.27 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  27.36 
 
 		 430 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  23.67 
 
 		 657 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  33.14 
 
 		 599 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  31.4 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  24.28 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  27.94 
 
 		 538 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  26.12 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  23.09 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  27.11 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  23.32 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  23.81 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  25.19 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  25 
 
 		 508 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  24.59 
 
 		 549 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  25 
 
 		 508 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  23.48 
 
 		 424 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 720 aa  55.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  23.91 
 
 		 584 aa  54.3  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  27.51 
 
 		 348 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  26.63 
 
 		 692 aa  53.5  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  21.11 
 
 		 692 aa  51.6  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  24.11 
 
 		 450 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 402 aa  50.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  23.95 
 
 		 563 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524.1  hypothetical protein  25.56 
 
 		 308 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  26.21 
 
 		 331 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  26.21 
 
 		 331 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  26.21 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  21.69 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  21.5 
 
 		 578 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  23.31 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  25.79 
 
 		 414 aa  44.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  24.6 
 
 		 527 aa  43.9  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>