More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0414 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  42.58 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  39.81 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.22 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.41 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.96 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 224 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.28 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  36.04 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.4 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.07 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  34.1 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 		 217 aa  137  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.21 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.24 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  37.32 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.47 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.11 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  35.24 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.45 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  35.42 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  36.06 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  32.21 
 
 		 272 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 272 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.63 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  32.56 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  34.63 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 		 461 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  30.66 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 272 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  34.02 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  31.19 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  32.04 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  31.79 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  32.85 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  34.29 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  31.73 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  31.73 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  31.73 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  31.73 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  31.73 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  31.73 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  31.73 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.88 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.8 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  32.8 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  31.41 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.81 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 		 256 aa  104  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 		 238 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.52 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.38 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.62 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>