237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1378 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  100 
 
 		 416 aa  868    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  31.15 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  27.25 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4380  integrase family protein  29.96 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4353  integrase family protein  25.69 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.59 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  26.62 
 
 		 357 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  26.17 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  24.35 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  22.9 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.09 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24.83 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.79 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.33 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.29 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  25 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  24 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.09 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  22.26 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  30.51 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  22.8 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.18 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  22.48 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  24.42 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  22.48 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  23.67 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  24.36 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  27.27 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  24.55 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.92 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  22.44 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  26.52 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  25.41 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  23.81 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.38 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  23.8 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  24.15 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  22.87 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  25.53 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  22.9 
 
 		 527 aa  57  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  21.57 
 
 		 339 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  23.46 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.79 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  25 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  25.52 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  24.83 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  25.56 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  24.81 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  22.19 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  27.27 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.43 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.1 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  22.67 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  25.79 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  23.25 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  22.48 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  20.99 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  23.87 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  21.21 
 
 		 339 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  28 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.78 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  19.69 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  20.89 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  20.88 
 
 		 353 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  23.51 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  23.95 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  22.66 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  22.66 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  22.76 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  23.97 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  21.77 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  20.99 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  21.92 
 
 		 305 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.83 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  21.59 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  26.5 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.46 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  23.35 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  22.91 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  20.83 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26.89 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  22.63 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  21.51 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  20.88 
 
 		 482 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3923  hypothetical protein  24.81 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  23.62 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  21.64 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  20.62 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>