More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3099 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3099  ROK family protein  100 
 
 		 385 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3308  ROK family protein  42.12 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.715302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  38.25 
 
 		 407 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1023  ROK family protein  42.94 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164512  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1190  ROK family protein  28.95 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.0524506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.8 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  30.13 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  30.73 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.9 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.63 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  34.63 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.38 
 
 		 418 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  28.65 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  20 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  29.48 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  29.88 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  32.92 
 
 		 417 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  26.41 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  30.06 
 
 		 417 aa  86.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  22.85 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.04 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  36.71 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  22.96 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  26.03 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  36.78 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  33.97 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.36 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.71 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.57 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.79 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  31.7 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  29.67 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  32.67 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  22.15 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  23.24 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  20.39 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.01 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  29.12 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.51 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  27.79 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.88 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0957  ROK family protein  26.81 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  34.82 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  22.65 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  22.51 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.92 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  27.32 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
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NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.77 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  27.7 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.46 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.66 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0976  ROK family protein  26.18 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  21.14 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  36.89 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  26.49 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  33.46 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  31.91 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.47 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  20.8 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  31.4 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  27.15 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  22.29 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.28 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  29.89 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  22.49 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.46 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  28.09 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  33.97 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  22.49 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  21.82 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.85 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.41 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  37.38 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  35.24 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  27.68 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  38.12 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  34.05 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3045  ROK family protein  23.19 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  32.75 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  28.41 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  21.52 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  28.94 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  27.89 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  29.66 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  29.43 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  31 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  27.93 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
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NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  28.37 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  17.88 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  32.53 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  27.32 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  32.32 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.45 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  28.17 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.51 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
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NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  31.45 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  38.89 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
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NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  25.38 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
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NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  17.43 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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