More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3045 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3045  ROK family protein  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3719  D-allose kinase  38.38 
 
 
297 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03956  D-allose kinase  35.55 
 
 
309 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.689878  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3907  ROK familiy protein  35.55 
 
 
309 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03916  hypothetical protein  35.55 
 
 
309 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4550  D-allose kinase  34.01 
 
 
309 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598137  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3942  D-allose kinase  35.22 
 
 
309 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1270  ROK family protein  29.08 
 
 
342 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253414  normal  0.41106 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  32.37 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.74 
 
 
316 aa  122  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.39 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  27.07 
 
 
328 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  26.4 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  28.48 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.56 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  30.23 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  30.04 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.67 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.76 
 
 
315 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.65 
 
 
410 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.22 
 
 
323 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  26.37 
 
 
389 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  26.5 
 
 
317 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  26.1 
 
 
278 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.88 
 
 
406 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  26.06 
 
 
310 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.13 
 
 
443 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  27.54 
 
 
299 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  26.38 
 
 
318 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  26.92 
 
 
305 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.84 
 
 
317 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  25.71 
 
 
318 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  28.66 
 
 
314 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  30.57 
 
 
325 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  28.66 
 
 
314 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.99 
 
 
300 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  26.07 
 
 
402 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  25.88 
 
 
392 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.14 
 
 
315 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  26.25 
 
 
402 aa  102  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  25.41 
 
 
393 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  28.92 
 
 
478 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  26.2 
 
 
395 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  28.46 
 
 
303 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  25.62 
 
 
354 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  27.02 
 
 
324 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  23.4 
 
 
410 aa  99.8  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  27.08 
 
 
395 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  25.09 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  23.17 
 
 
352 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  25.08 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  26.54 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  24.91 
 
 
405 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  27.54 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  26.17 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  28.08 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  26.17 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  26.17 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  26.17 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  26.17 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.57 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  25.97 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  25.97 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  26.17 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  27.76 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  26.17 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  28.8 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  26.45 
 
 
408 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  26.82 
 
 
405 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  27.83 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.04 
 
 
405 aa  95.9  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  25.8 
 
 
427 aa  96.3  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  24.18 
 
 
319 aa  96.3  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  27.51 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  27.91 
 
 
322 aa  95.9  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  25.33 
 
 
325 aa  95.9  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  27.92 
 
 
307 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  25.25 
 
 
310 aa  95.9  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  27.05 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  25.86 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.04 
 
 
434 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  27.24 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  25.99 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  26.02 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  26.4 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  28.43 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  26.38 
 
 
327 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  25.71 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  27.72 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.72 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  25.4 
 
 
401 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  27.72 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  29.18 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  23.99 
 
 
420 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  27.72 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  26.43 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  27.72 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  27.72 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  26.47 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.72 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>