More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4550 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4550  D-allose kinase  100 
 
 		 309 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598137  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03956  D-allose kinase  97.09 
 
 		 309 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.689878  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3907  ROK familiy protein  97.09 
 
 		 309 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03916  hypothetical protein  97.09 
 
 		 309 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3942  D-allose kinase  96.76 
 
 		 309 aa  621  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3719  D-allose kinase  33.9 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3045  ROK family protein  34.01 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.47 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1270  ROK family protein  30.19 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253414  normal  0.41106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.39 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  27.99 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.45 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  25.76 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.67 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  29.45 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.45 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.45 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  28.38 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.45 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.45 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.45 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  28.74 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.5 
 
 		 404 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  32.7 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  31.37 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  23.7 
 
 		 385 aa  89.7  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  27.48 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  29.81 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  29.49 
 
 		 408 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.5 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  26.69 
 
 		 311 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  28.95 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  28.52 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  30.23 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.04 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  26.91 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  30.7 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.04 
 
 		 410 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  29.58 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  29.39 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  30.26 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.44 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.44 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.26 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  28.09 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  27.92 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  24.06 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.44 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  27.01 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  23.86 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1583  ROK family protein  27.45 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.230527 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  27.1 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  27.1 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  27.1 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  34.98 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  28.14 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  26.05 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  27.76 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  26.89 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  25.61 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.63 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  26.89 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  28.62 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  28.62 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  26.71 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  26.97 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4485  ROK family protein  27.51 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  29.23 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  25 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  34.25 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  26.25 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  27.3 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  30.17 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  28.96 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  26.69 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  26.69 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  27.18 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  24.58 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  28.1 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  29.24 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  24.76 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  26.75 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  28.9 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.38 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  24.71 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  25.32 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  28.96 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  26.67 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  26.67 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.01 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  27.27 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  27.27 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  27.5 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  26.92 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  26.39 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  30.06 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2919  ROK family protein  33.78 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0770756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  28.94 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  25.48 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>