More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1453 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  100 
 
 		 325 aa  659    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  44.26 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  45.48 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  41.39 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  37.12 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  34.11 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  31.86 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  32.28 
 
 		 324 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  33.23 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  33.56 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  33 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  34.94 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  32.62 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  31.94 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.15 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  31.9 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.54 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.78 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.95 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  33.8 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.75 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.82 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.82 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  33.57 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  29.9 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  31.16 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  28.62 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  30.82 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  29.78 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  29.78 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  31.43 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  29.34 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.23 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  29.85 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  34.69 
 
 		 409 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  30.7 
 
 		 314 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  30.25 
 
 		 320 aa  109  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  29.87 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  30.12 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  32.25 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  28.34 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  28.57 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.25 
 
 		 395 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.65 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.53 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  26.06 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  28.1 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  33.98 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  32.28 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  32.28 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.92 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.72 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  29.5 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  31.96 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  29.05 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  29.74 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  26.93 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  33.54 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  28.53 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.53 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  29.41 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  27.8 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  30.72 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.99 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  30.39 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.64 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.41 
 
 		 397 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  27.16 
 
 		 321 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  28.66 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  29.43 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  28.66 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  28.08 
 
 		 316 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  29.39 
 
 		 321 aa  99.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  31.56 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  29.11 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.13 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  32.49 
 
 		 443 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  30 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.08 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.56 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  29.3 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  28.53 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.77 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.07 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  30.63 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  29.28 
 
 		 401 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  34.39 
 
 		 363 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  28.52 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  28.17 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>