More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0043 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  100 
 
 
326 aa  647    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  72.56 
 
 
320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  68.85 
 
 
323 aa  455  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  67.8 
 
 
325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  68.34 
 
 
324 aa  443  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  53.13 
 
 
339 aa  332  6e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  38.51 
 
 
319 aa  202  7e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  38.61 
 
 
332 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  33.23 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  36.13 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  33.98 
 
 
315 aa  146  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  35.26 
 
 
308 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  31.83 
 
 
323 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  35.47 
 
 
296 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  34.54 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.85 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.02 
 
 
315 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.02 
 
 
315 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  33.96 
 
 
321 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  30.28 
 
 
318 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  34.7 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.8 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2058  ROK family protein  40.2 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.46 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.44 
 
 
321 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.22 
 
 
317 aa  109  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.69 
 
 
312 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.57 
 
 
300 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  31.96 
 
 
314 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.06 
 
 
352 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  30.93 
 
 
347 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.25 
 
 
316 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  32.81 
 
 
314 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  32.81 
 
 
314 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0500  glucokinase  33.49 
 
 
336 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  32.91 
 
 
315 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  26.69 
 
 
312 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  29.51 
 
 
308 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.23 
 
 
391 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0516  ROK family protein  33.49 
 
 
336 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.24 
 
 
397 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.41 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.21 
 
 
395 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  32.64 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.53 
 
 
320 aa  99  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  31.95 
 
 
336 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30 
 
 
408 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.99 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  36.19 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  28.89 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  33.02 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  33.23 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.71 
 
 
315 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.87 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  27.62 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  27.62 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  29.71 
 
 
340 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.19 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  28.76 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  32.17 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  29.39 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  27.3 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  28.3 
 
 
322 aa  90.1  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  27.3 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  27.3 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  27.3 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  27.3 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  27.3 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  27.3 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  27.3 
 
 
327 aa  89.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.27 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.34 
 
 
404 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  26.98 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.91 
 
 
410 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  30.25 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  29.79 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  28.91 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  32.92 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  29.84 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  27.91 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4213  glucokinase  32.21 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  32.17 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  31.41 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  29.84 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  33.65 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  24.63 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  36.73 
 
 
305 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  27.84 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  27.11 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  29.25 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  27.91 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  27.04 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.57 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  27.88 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  33.51 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  26.71 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.15 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  28.46 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.16 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  29.52 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>