More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1032 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  73.63 
 
 		 315 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  72.64 
 
 		 296 aa  429  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  71.77 
 
 		 297 aa  404  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  44.1 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  36.54 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  36.66 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  36.13 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  33.11 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  34.94 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  33.33 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  35.69 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  31.75 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.05 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.05 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  31.31 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  34.3 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  31.9 
 
 		 325 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  31.27 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.1 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.31 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  34.4 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.77 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.99 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.66 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  30.84 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  33.69 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.47 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  34.4 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  32.68 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.71 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.27 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  33.85 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.26 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  31.37 
 
 		 324 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  31.49 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  33.01 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  33.01 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  31.01 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.75 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  32.59 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  31.05 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  31.05 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  31.05 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  29.62 
 
 		 321 aa  92  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.29 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.29 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  29.29 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.12 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  32.68 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  31.2 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.41 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  26.35 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  27.03 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  29.66 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  23.91 
 
 		 385 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  26.6 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.15 
 
 		 352 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  30.25 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  27.13 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.21 
 
 		 410 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.88 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 336 aa  86.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  28.89 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.51 
 
 		 396 aa  85.9  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.41 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.21 
 
 		 409 aa  85.5  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  29.46 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  26.26 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.83 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  31.41 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  31.83 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.54 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  31.99 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  27.8 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  30.97 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  29.75 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  32.13 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  28.24 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  36.36 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  28.34 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.39 
 
 		 399 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  31.55 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  35.86 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  25.55 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0014  ROK family protein  29.51 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  35.86 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.05 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  30.23 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  29.06 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  28.8 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  32.34 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  26.9 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  33.17 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  31.15 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  26.26 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.64 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.17 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>