More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1668 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  664    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  43.14 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  41.39 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  41.14 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  32.89 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  33.44 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  34.16 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  34.98 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  31.96 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  33.11 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  31.63 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  31.83 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  29.88 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  31.94 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  29.03 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.03 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.37 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.37 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.73 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  33.11 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.1 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  36.08 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  28.71 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.84 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.44 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  27.2 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.83 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  27.17 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.52 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.43 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  28.52 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  28.81 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2058  ROK family protein  29.52 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  28.99 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.48 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  30.57 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  28.16 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  29.21 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  29.96 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  30.04 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  28.78 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  27.82 
 
 		 405 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  28.28 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  30.15 
 
 		 406 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.99 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  28.12 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.01 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0014  ROK family protein  29.17 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  28.79 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  28.62 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.76 
 
 		 391 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  28.75 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  29.38 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  28.79 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  28.79 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  28.79 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.8 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  28.79 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  29.44 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  29.44 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  29.44 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  27.33 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  27.59 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  29.44 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  29.44 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  29.44 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.2 
 
 		 396 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25.23 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  29.44 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  28.74 
 
 		 429 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  29.44 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  29.44 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.77 
 
 		 408 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  27.2 
 
 		 390 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  29.52 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.72 
 
 		 312 aa  89.4  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  28.5 
 
 		 404 aa  89.4  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  25.54 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  26.07 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  31.94 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.62 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  33.51 
 
 		 409 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.75 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  26.96 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  25.66 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  30.28 
 
 		 478 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  29.37 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  29.5 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  31.46 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  27.03 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  27.51 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.91 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  26.54 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  26.99 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.35 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  30 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  31.5 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  27.92 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  30.38 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>