More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06730 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 
341 aa  676    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  48.89 
 
 
316 aa  263  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  43.47 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  42.33 
 
 
318 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  34.42 
 
 
363 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3392  ROK family protein  36.65 
 
 
329 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0183  ROK family protein  39.13 
 
 
324 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3770  ROK family protein  38.21 
 
 
314 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  33.03 
 
 
320 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.94 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.94 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  34.92 
 
 
317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  33.43 
 
 
342 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.57 
 
 
299 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  29.81 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.75 
 
 
406 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  34.36 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.06 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  30.82 
 
 
314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2121  ROK family protein  40.93 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  32.58 
 
 
429 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35 
 
 
401 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.18 
 
 
409 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  35.18 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  32.4 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2139  ROK family protein  37.58 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  30.97 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  34.17 
 
 
313 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32.53 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.16 
 
 
312 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  33.95 
 
 
312 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.34 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  28.16 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  32.17 
 
 
318 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  33.23 
 
 
332 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  35.59 
 
 
387 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  28.16 
 
 
292 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.76 
 
 
300 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  30.74 
 
 
336 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  33.93 
 
 
361 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.91 
 
 
315 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.51 
 
 
410 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.77 
 
 
352 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  30.22 
 
 
308 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  27.94 
 
 
321 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.71 
 
 
306 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  28.84 
 
 
295 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  29.97 
 
 
321 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33.83 
 
 
389 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.8 
 
 
300 aa  105  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  26.93 
 
 
335 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.44 
 
 
323 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  26.75 
 
 
292 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.01 
 
 
390 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  32.87 
 
 
427 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  29.62 
 
 
313 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29 
 
 
347 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  31.78 
 
 
332 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.97 
 
 
315 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  31.8 
 
 
313 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  30.84 
 
 
420 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  31.78 
 
 
306 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  33.46 
 
 
402 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  33.48 
 
 
311 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  35.66 
 
 
395 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  28.66 
 
 
312 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  31.79 
 
 
318 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  33.58 
 
 
400 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  29.69 
 
 
327 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.69 
 
 
327 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  28.21 
 
 
292 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.69 
 
 
327 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  29.69 
 
 
327 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  29.69 
 
 
327 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  30.67 
 
 
314 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  29.69 
 
 
327 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  32.48 
 
 
321 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  29.69 
 
 
327 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  26.98 
 
 
292 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  27.39 
 
 
292 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  27.39 
 
 
292 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  29.32 
 
 
317 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  26.75 
 
 
292 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  28.73 
 
 
302 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  29.65 
 
 
325 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  30.75 
 
 
363 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  27.22 
 
 
292 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  28.34 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0679  ROK family protein  30.7 
 
 
307 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.26 
 
 
400 aa  99.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  31.43 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  28.62 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  33.58 
 
 
409 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.21 
 
 
396 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.38 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  28.61 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  27.95 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.38 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.21 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  30.45 
 
 
389 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>