More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0982 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  100 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  64.81 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  64.54 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4213  glucokinase  66.34 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0500  glucokinase  60.57 
 
 		 336 aa  319  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0516  ROK family protein  60.25 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.5 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.06 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  31.31 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.19 
 
 		 315 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.28 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.28 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  30.3 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  29.43 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  34.4 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  30.07 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  30.89 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.23 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  30.04 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  28.57 
 
 		 325 aa  95.5  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  31.53 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  34.21 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.99 
 
 		 401 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  27.82 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  29.09 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  26.87 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.89 
 
 		 391 aa  89.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.38 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.71 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  33.33 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  31.98 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.3 
 
 		 389 aa  85.9  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.22 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  33.17 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  26.85 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  30.21 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3527  N-acetylmannosamine kinase  31.95 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3634  N-acetylmannosamine kinase  31.95 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3599  N-acetylmannosamine kinase  31.95 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3696  N-acetylmannosamine kinase  31.95 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  28.85 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  29.1 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.32 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.23 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.8 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  30.6 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  26.71 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  31.72 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3529  N-acetylmannosamine kinase  31.58 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  31.72 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  31.72 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  30.7 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.78 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4539  N-acetylmannosamine kinase  31.84 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  27.72 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  32.31 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  23.95 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  29.95 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03082  N-acetylmannosamine kinase  31.46 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  29.32 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  28.39 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03033  hypothetical protein  31.46 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3517  N-acetylmannosamine kinase  31.09 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  31.75 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3410  N-acetylmannosamine kinase  31.46 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0484  N-acetylmannosamine kinase  31.46 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3704  N-acetylmannosamine kinase  31.46 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.338423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0003  glucokinase  33.33 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000615827  normal  0.192124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0484  ROK familiy protein  30.37 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  27.91 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.31 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3554  N-acetylmannosamine kinase  31.84 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  28.38 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  33.98 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.81 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.42 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.88 
 
 		 434 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  27.79 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.5 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  29.57 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  28.16 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  27.73 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.37 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.34 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  34.84 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  29.33 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0651  sugar kinase  31.71 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0799966  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  27.82 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2107  6-phosphate glucose kinase  26.28 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  26.52 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  27.54 
 
 		 429 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  25.41 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  24.09 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  25.41 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3659  N-acetylmannosamine kinase  30.71 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  37.34 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  24.83 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0983  glucokinase  32.13 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157421  normal  0.169764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>