More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4084 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  100 
 
 
323 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  66.15 
 
 
330 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  64.81 
 
 
308 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4213  glucokinase  60.06 
 
 
311 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0516  ROK family protein  57.8 
 
 
336 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0500  glucokinase  57.49 
 
 
336 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  35.95 
 
 
321 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  36.11 
 
 
321 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.7 
 
 
315 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.7 
 
 
315 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  30.42 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  30.18 
 
 
319 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.46 
 
 
315 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  31.01 
 
 
324 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.18 
 
 
402 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.58 
 
 
401 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.14 
 
 
422 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.57 
 
 
322 aa  96.3  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  28.48 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.06 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  31.1 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  30.53 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  29.85 
 
 
305 aa  92.8  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.19 
 
 
417 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  29.77 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  28.62 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  28.87 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  26.45 
 
 
325 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  26.58 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.2 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.21 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  31.58 
 
 
434 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  27.51 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  26.13 
 
 
389 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  30.6 
 
 
405 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.63 
 
 
391 aa  86.3  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3770  ROK family protein  30.14 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  27.91 
 
 
326 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  29.65 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  33.64 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  27.72 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  29.46 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  32.27 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.07 
 
 
387 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  29.75 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  28.83 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  29.65 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.15 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  29.12 
 
 
417 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  28.46 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.97 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.69 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  28.67 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.56 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  28.06 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.79 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.45 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  30.47 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  30.47 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  30.47 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.43 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.9 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  34.21 
 
 
401 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  27.87 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  35.83 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  30.22 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  26.54 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.67 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.57 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  36.24 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.23 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  27.75 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  34.39 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.69 
 
 
404 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  32.74 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  34.03 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  31.64 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.09 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.65 
 
 
443 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.26 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0242  ROK domain-containing protein  32.97 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.981562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  31.25 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  30.46 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  31.58 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.5 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  31.77 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.73 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.1 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  31.23 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  24.74 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
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NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  31.23 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  27.67 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  31.41 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  26.67 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
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NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  30.58 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  33.05 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  27.3 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  26.07 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  29.13 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
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