More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4213 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4213  glucokinase  100 
 
 
311 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  66.34 
 
 
308 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  60.06 
 
 
323 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  58.73 
 
 
330 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0500  glucokinase  65.19 
 
 
336 aa  346  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0516  ROK family protein  65.19 
 
 
336 aa  344  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  30.94 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.66 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.7 
 
 
322 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.44 
 
 
321 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32 
 
 
321 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.92 
 
 
315 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.92 
 
 
315 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  35.68 
 
 
324 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  26.57 
 
 
332 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  30.33 
 
 
323 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  29.24 
 
 
325 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  29.78 
 
 
292 aa  99  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  30.51 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  31.18 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  29.8 
 
 
320 aa  96.3  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.07 
 
 
401 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  29.39 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  29.1 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  32.77 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  31.66 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3529  N-acetylmannosamine kinase  35.29 
 
 
291 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  27.95 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3634  N-acetylmannosamine kinase  34.93 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3696  N-acetylmannosamine kinase  34.93 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3599  N-acetylmannosamine kinase  34.93 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.84 
 
 
402 aa  85.9  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  32.59 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3527  N-acetylmannosamine kinase  34.69 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.68 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  29.79 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  31.71 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  28.66 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  29.17 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.67 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.25 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  29.43 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  29.97 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  40.62 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.18 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  29.97 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  31.99 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  31.99 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  31.99 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3659  N-acetylmannosamine kinase  32.36 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  33.22 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  31.48 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  29.41 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  25.68 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.64 
 
 
389 aa  79  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  30.51 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  29.74 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.6 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  31.07 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4539  N-acetylmannosamine kinase  34.56 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524903  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  27.7 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  29.02 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  29.41 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.57 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  29.82 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.22 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  31.31 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3554  N-acetylmannosamine kinase  34.19 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  24.35 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  34.55 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3704  N-acetylmannosamine kinase  34.19 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.338423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0484  N-acetylmannosamine kinase  34.19 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03082  N-acetylmannosamine kinase  34.19 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03033  hypothetical protein  34.19 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.77 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3410  N-acetylmannosamine kinase  34.19 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  28.47 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  30.62 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  34.03 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  26.99 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  29.04 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.54 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  30.14 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3517  N-acetylmannosamine kinase  33.82 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  27.87 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  32.21 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  33.94 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  25.76 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  34.01 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  31.35 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  30.2 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
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NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  30.3 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.62 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  32.21 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0484  ROK familiy protein  33.82 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.22 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.52 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.67 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  28.04 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  32.26 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
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