More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0516 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0516  ROK family protein  100 
 
 		 336 aa  656    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0500  glucokinase  97.92 
 
 		 336 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4213  glucokinase  65.19 
 
 		 311 aa  364  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  60.25 
 
 		 308 aa  352  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  57.8 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  58.13 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  30.82 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  29.22 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  32.89 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  30.56 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  30.92 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  30.09 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.75 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.75 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.86 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  30.72 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.92 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  27.33 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.94 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.11 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  29.89 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  29.34 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  30.87 
 
 		 336 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.54 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.3 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  28.07 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  31.09 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.03 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.06 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.3 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  29.88 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  30.22 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  30.42 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  32.01 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  31.15 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  31.76 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.59 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  31.71 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  32.7 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  31.1 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.78 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  30.34 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  28.44 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  31.36 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4997  ROK family protein  29.77 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.008379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24 
 
 		 410 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  30.65 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.1 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  31.06 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  28.99 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  29.39 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  25.95 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0335  ROK family protein  27.27 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  29.93 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  29.79 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.95 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  24.09 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  31.87 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  31.87 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  31.87 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.25 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  28.48 
 
 		 352 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.48 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.96 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  26.71 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  28.8 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  26.25 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  33.33 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  28.53 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.08 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  29.82 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.34 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.24 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  27.96 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  29.93 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  30.13 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.15 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  27.59 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  33.66 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  26.3 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.1 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  32.5 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.2 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  30.51 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  32.19 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  34.17 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  22.05 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0965  glucokinase  32.37 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0983  glucokinase  32.37 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157421  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  29.88 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  28.71 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1177  ROK family protein  28.97 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10663  sugar kinase  31.92 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.97302e-41  normal  0.432322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  33.51 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  27.78 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  26.42 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  40 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  30.43 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.85 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>