More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3719 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3719  D-allose kinase  100 
 
 		 297 aa  613  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3045  ROK family protein  38.38 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4550  D-allose kinase  33.9 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598137  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03956  D-allose kinase  33.22 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.689878  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3907  ROK familiy protein  33.22 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03916  hypothetical protein  33.22 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3942  D-allose kinase  33.22 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1270  ROK family protein  29.64 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253414  normal  0.41106 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.23 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  33.46 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  30.19 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  30.68 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4485  ROK family protein  30.3 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  35.75 
 
 		 325 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  30.68 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  27.62 
 
 		 393 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  30.68 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  30.68 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  31.82 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  31.82 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  31.82 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  30.68 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  31.82 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  31.82 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  31.82 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  29.3 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  30.84 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  31.44 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  31.44 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  26.53 
 
 		 389 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  30.5 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  27.51 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  26.79 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  30.27 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  30.6 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  23.62 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  30.23 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  31.62 
 
 		 395 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.78 
 
 		 406 aa  99  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  30.33 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  22.71 
 
 		 408 aa  99  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  31.5 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  28.53 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.42 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  30.87 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  31.01 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.24 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  27.81 
 
 		 420 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.55 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  28.62 
 
 		 389 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  31.73 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  30.94 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  30.1 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.1 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.1 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  27.34 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  26.28 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  30.59 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  29.69 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.66 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  27.6 
 
 		 307 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.04 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.57 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  26.86 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  27.18 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.77 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.77 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.84 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.83 
 
 		 402 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  29.78 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.68 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.84 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  27.91 
 
 		 395 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.44 
 
 		 410 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  30.57 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  29.08 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  28.95 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  24.7 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  29.55 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  30.15 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.21 
 
 		 390 aa  93.2  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  29.07 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24 
 
 		 401 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  26.82 
 
 		 401 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.66 
 
 		 395 aa  92.4  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  23.78 
 
 		 404 aa  92.4  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  29.02 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.4 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  28.96 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  27.64 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  27.71 
 
 		 352 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  28.8 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  28.35 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  28.52 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  25.24 
 
 		 405 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  31.16 
 
 		 405 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  25.53 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  29.15 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  30.2 
 
 		 321 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2474  ROK family protein  29.92 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>