More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1270 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1270  ROK family protein  100 
 
 		 342 aa  688    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253414  normal  0.41106 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3045  ROK family protein  29.08 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3719  D-allose kinase  29.64 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03956  D-allose kinase  30.09 
 
 		 309 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.689878  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3907  ROK familiy protein  30.09 
 
 		 309 aa  123  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03916  hypothetical protein  30.09 
 
 		 309 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3942  D-allose kinase  30.09 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4550  D-allose kinase  30.19 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.91 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  30.98 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.55 
 
 		 300 aa  95.9  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.38 
 
 		 306 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.98 
 
 		 320 aa  94  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.4 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.48 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.48 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  27.88 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  29.09 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.17 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  35.48 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  32.25 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  31.09 
 
 		 299 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  27.11 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0651  sugar kinase  33.5 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0799966  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.27 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.23 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.1 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  26.32 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.67 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  30.49 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.8 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  32.72 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.11 
 
 		 389 aa  85.9  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  31.17 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  29.18 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  27.87 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.04 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  25 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  30.92 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30.84 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  32.22 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  29.86 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0014  ROK family protein  26.58 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  30.61 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.52 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  25.61 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  27.83 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  30.34 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.08 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  29.03 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  28.7 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  28.19 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  27.73 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  24.92 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  27.91 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  30.71 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  34.97 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  28.17 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.93 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  27.74 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.54 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  26.71 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.3 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  27.84 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.89 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  29.79 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  32.67 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  34.59 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  27.73 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  31.1 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  27.01 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  32.57 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2121  ROK family protein  36.72 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.56 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.74 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  32.05 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.8 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  27.5 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  24.91 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  28.26 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  28.26 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  26.33 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  25.23 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.72 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  27.54 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  29.03 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  33.33 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  25.74 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  26.86 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.36 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  32.04 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.24 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  32.04 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  28.31 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  27.88 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  28.51 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  29.51 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  31.09 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  28.51 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  29.96 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>