More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2121 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2121  ROK family protein  100 
 
 
306 aa  564  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3392  ROK family protein  46.18 
 
 
329 aa  175  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  52.43 
 
 
363 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  39.16 
 
 
329 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  36.77 
 
 
328 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  45.16 
 
 
318 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0183  ROK family protein  43.23 
 
 
324 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  39.74 
 
 
316 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3770  ROK family protein  44.18 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  35.87 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  30.03 
 
 
317 aa  142  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  38.99 
 
 
341 aa  139  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  38.72 
 
 
306 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.24 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.69 
 
 
321 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  33.23 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  33.55 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  37.09 
 
 
392 aa  125  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  33.87 
 
 
314 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  36.39 
 
 
342 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  39.06 
 
 
306 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.03 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.65 
 
 
389 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.74 
 
 
352 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.55 
 
 
313 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.2 
 
 
298 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.01 
 
 
410 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  32.92 
 
 
335 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.43 
 
 
312 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  36.05 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  34.37 
 
 
393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  34.45 
 
 
395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  34.95 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  33.02 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  34.28 
 
 
311 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.39 
 
 
312 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  36.91 
 
 
313 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  38.51 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  35.24 
 
 
389 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  37.82 
 
 
398 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  27.39 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.96 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.11 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  36.75 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  32.67 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  34.67 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.54 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  39.24 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  35.91 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.85 
 
 
297 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  37 
 
 
310 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.85 
 
 
297 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  33.99 
 
 
478 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0679  ROK family protein  36.75 
 
 
307 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  35.64 
 
 
403 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  30.33 
 
 
395 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  33.97 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  34.15 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  35.37 
 
 
318 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  39.31 
 
 
329 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  31.11 
 
 
314 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  33.56 
 
 
390 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.77 
 
 
315 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.77 
 
 
315 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.67 
 
 
303 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  34 
 
 
409 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  34.49 
 
 
332 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  31.7 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.01 
 
 
327 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.01 
 
 
327 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.01 
 
 
327 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.01 
 
 
327 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.01 
 
 
327 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  33.85 
 
 
443 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.01 
 
 
327 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.01 
 
 
327 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  29.62 
 
 
372 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  28.29 
 
 
316 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  34.67 
 
 
395 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.62 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  31.44 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.62 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  35.45 
 
 
372 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  31.31 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  30.9 
 
 
336 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.82 
 
 
327 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  30.56 
 
 
334 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  35.21 
 
 
307 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  29.66 
 
 
321 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  31.31 
 
 
302 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.62 
 
 
302 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  31.31 
 
 
302 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.89 
 
 
388 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  31.63 
 
 
331 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  27.6 
 
 
295 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  27.6 
 
 
295 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  31.31 
 
 
302 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  35.46 
 
 
389 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  35.77 
 
 
307 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  31.31 
 
 
302 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>