More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2365 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  42.61 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.13 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  40.82 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 159 aa  52  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  36.05 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.93 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  54 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  26.09 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.89 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  28.23 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  28.74 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  35.06 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  28.95 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  30.12 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>