More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2988 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  65.48 
 
 		 701 aa  889    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  53.78 
 
 		 680 aa  712    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 700 aa  1392    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  66.42 
 
 		 694 aa  901    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  51.92 
 
 		 689 aa  741    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  54.06 
 
 		 696 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  56.77 
 
 		 695 aa  684    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  53.12 
 
 		 691 aa  658    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  46.47 
 
 		 698 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  45.51 
 
 		 699 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  45.58 
 
 		 703 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  46.91 
 
 		 698 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  46.82 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  46.17 
 
 		 698 aa  545  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  47.94 
 
 		 700 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 701 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  41.16 
 
 		 707 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  41.88 
 
 		 707 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 680 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  43.86 
 
 		 683 aa  488  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  44.38 
 
 		 677 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  44.01 
 
 		 707 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  44.38 
 
 		 677 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  44.38 
 
 		 677 aa  485  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 689 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 		 713 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  40.06 
 
 		 706 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  44.9 
 
 		 677 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  43.2 
 
 		 691 aa  475  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  45.03 
 
 		 705 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  44.99 
 
 		 679 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  43.92 
 
 		 687 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  44.31 
 
 		 676 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  44.77 
 
 		 677 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 		 680 aa  458  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 		 685 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.31 
 
 		 678 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 		 684 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 730 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 730 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  37.47 
 
 		 729 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 		 726 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 		 729 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 684 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  35.3 
 
 		 698 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 688 aa  343  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 688 aa  340  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  35.88 
 
 		 682 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 653 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 705 aa  334  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 705 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 705 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 		 705 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  33.15 
 
 		 705 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 705 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 657 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 657 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 		 705 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  33.15 
 
 		 706 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 715 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  33 
 
 		 690 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 701 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 652 aa  280  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 664 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 		 571 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 413 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 		 413 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  36.54 
 
 		 259 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 260 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 		 255 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.75 
 
 		 266 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.08 
 
 		 260 aa  144  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41 
 
 		 260 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.52 
 
 		 265 aa  137  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.88 
 
 		 260 aa  137  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 257 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.55 
 
 		 260 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.77 
 
 		 249 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 262 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 269 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  35.88 
 
 		 255 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  34.36 
 
 		 255 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.22 
 
 		 260 aa  132  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.84 
 
 		 260 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 255 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.75 
 
 		 255 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 		 255 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 254 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 255 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 		 255 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.17 
 
 		 261 aa  128  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.17 
 
 		 261 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 255 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.17 
 
 		 261 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 		 255 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 255 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 266 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.36 
 
 		 259 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 255 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>