More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1935 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  67.59 
 
 		 226 aa  292  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  51.94 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  46.38 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  49.05 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  44.93 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  50 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  47.13 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  49.46 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  43.19 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  45.29 
 
 		 191 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  44.91 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  42.35 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  37.89 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  37.89 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  35.85 
 
 		 174 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  38.79 
 
 		 182 aa  98.6  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  37.74 
 
 		 185 aa  98.6  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  33.14 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  39.51 
 
 		 186 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  35.44 
 
 		 178 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  36.02 
 
 		 189 aa  95.9  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  37.58 
 
 		 201 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  38.36 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  33.13 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  38.99 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  39.1 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  39.1 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  34.78 
 
 		 190 aa  92.4  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  39.33 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  35.91 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  33.33 
 
 		 171 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  32.79 
 
 		 190 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  37.01 
 
 		 177 aa  91.7  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  38.26 
 
 		 177 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  37.91 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  33.96 
 
 		 171 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  32.93 
 
 		 192 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  37.91 
 
 		 177 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  33.73 
 
 		 176 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  33.33 
 
 		 180 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.95 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  33.95 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  37.65 
 
 		 188 aa  89.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  31.68 
 
 		 179 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  35.9 
 
 		 174 aa  89  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  34.78 
 
 		 196 aa  89  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  38.61 
 
 		 177 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  37.97 
 
 		 179 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  35.85 
 
 		 176 aa  88.2  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  36.77 
 
 		 154 aa  88.2  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  31.93 
 
 		 190 aa  88.2  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  36.31 
 
 		 189 aa  88.2  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  37.25 
 
 		 177 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  32.11 
 
 		 175 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  37.85 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  37.68 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  34.91 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  35.95 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  38.22 
 
 		 179 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  37.42 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  37.97 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  34.59 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  35.4 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  39.26 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  38.85 
 
 		 164 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  36.14 
 
 		 181 aa  86.7  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  35.8 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  37.34 
 
 		 179 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  35.85 
 
 		 173 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  34.62 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  31.87 
 
 		 169 aa  86.3  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  36.81 
 
 		 178 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  29.75 
 
 		 177 aa  85.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  34.18 
 
 		 178 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  32.24 
 
 		 178 aa  85.9  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  37.09 
 
 		 165 aa  85.5  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  34.18 
 
 		 178 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  38.56 
 
 		 177 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  38.56 
 
 		 177 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  37.04 
 
 		 185 aa  85.1  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  38.56 
 
 		 177 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  38.56 
 
 		 177 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  38.56 
 
 		 177 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  37.57 
 
 		 179 aa  85.5  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  38.56 
 
 		 177 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  32.3 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  36.71 
 
 		 174 aa  84.7  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  36.81 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  38.75 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  34.78 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  34.81 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  33.55 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  37.91 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  34.18 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  37.58 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  32.05 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  32 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>