More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1017 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 544 aa  1097    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  52.12 
 
 		 544 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  49.18 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  47.27 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  45.5 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.81 
 
 		 538 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  46.59 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  45.57 
 
 		 563 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  47.34 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  43.2 
 
 		 593 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.15 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  48.91 
 
 		 538 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  46.88 
 
 		 522 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  47.05 
 
 		 543 aa  438  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  45.76 
 
 		 571 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  47.36 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  45.62 
 
 		 560 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  45.39 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  49.26 
 
 		 550 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  44.24 
 
 		 605 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  45.22 
 
 		 567 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  45.09 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  44.21 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  48.06 
 
 		 609 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  45.06 
 
 		 607 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  45.16 
 
 		 587 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  45.9 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  43.44 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  45.09 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  51.91 
 
 		 634 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.08 
 
 		 511 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  46.2 
 
 		 573 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  48.04 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  45.94 
 
 		 546 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  45.96 
 
 		 524 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  50.84 
 
 		 594 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  45.39 
 
 		 546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  48.46 
 
 		 555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  45.12 
 
 		 512 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  43.5 
 
 		 640 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  43.65 
 
 		 533 aa  405  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  43.72 
 
 		 576 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  44.62 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  46.55 
 
 		 532 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  48.86 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  43.54 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  47.48 
 
 		 599 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  44.86 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  39.28 
 
 		 604 aa  385  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  45.76 
 
 		 543 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  42.96 
 
 		 558 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  44.27 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  44.27 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  43.91 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  45.12 
 
 		 554 aa  379  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  41.7 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  42.68 
 
 		 548 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  38.74 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  40.03 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  44.08 
 
 		 561 aa  363  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  42.61 
 
 		 580 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  40.21 
 
 		 570 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  41.36 
 
 		 567 aa  359  8e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  37.94 
 
 		 572 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  40.48 
 
 		 556 aa  335  9e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.9 
 
 		 515 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  37.22 
 
 		 553 aa  319  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  39.1 
 
 		 543 aa  315  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.13 
 
 		 533 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.87 
 
 		 540 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  41.72 
 
 		 537 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  37.13 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  41.81 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  41.36 
 
 		 541 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  39.04 
 
 		 549 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  38.03 
 
 		 530 aa  299  9e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  39.34 
 
 		 532 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  37.05 
 
 		 538 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  40.7 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  36.31 
 
 		 536 aa  296  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  39.04 
 
 		 525 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 529 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  42.27 
 
 		 535 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  39.75 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  41.83 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.81 
 
 		 537 aa  291  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.76 
 
 		 528 aa  290  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  38.12 
 
 		 555 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  40.21 
 
 		 735 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  39.63 
 
 		 550 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  37.41 
 
 		 540 aa  286  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  36.31 
 
 		 568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 543 aa  286  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  37.45 
 
 		 553 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  37.71 
 
 		 539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.07 
 
 		 539 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  38.91 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  39.15 
 
 		 550 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  37.77 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>