More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0935 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  100 
 
 		 789 aa  1507    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0884  ATP dependent DNA ligase  87.36 
 
 		 726 aa  1034    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.911309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0932  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  97.2 
 
 		 737 aa  1235    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  67.24 
 
 		 847 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  50 
 
 		 896 aa  310  6.999999999999999e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  44.23 
 
 		 871 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  41.59 
 
 		 872 aa  266  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  42.11 
 
 		 882 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  38.36 
 
 		 900 aa  264  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  38.91 
 
 		 882 aa  262  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  39.04 
 
 		 881 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  39.81 
 
 		 534 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  40.44 
 
 		 864 aa  258  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  39.61 
 
 		 911 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  38.58 
 
 		 883 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  41.36 
 
 		 832 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  34.85 
 
 		 896 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  37.5 
 
 		 893 aa  251  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  41.65 
 
 		 901 aa  251  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  40.59 
 
 		 833 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  38.08 
 
 		 848 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  36.41 
 
 		 853 aa  249  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  39.13 
 
 		 845 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  39.67 
 
 		 817 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  37.5 
 
 		 913 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  38.02 
 
 		 856 aa  247  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  35.21 
 
 		 855 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  40 
 
 		 888 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  35.1 
 
 		 877 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  40.49 
 
 		 822 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  38.3 
 
 		 918 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  37.8 
 
 		 895 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  39.76 
 
 		 833 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  39.59 
 
 		 886 aa  244  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  40 
 
 		 863 aa  244  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  40.24 
 
 		 833 aa  244  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  37.79 
 
 		 865 aa  243  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  34.06 
 
 		 815 aa  243  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  40.49 
 
 		 851 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  39.9 
 
 		 871 aa  241  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  39.06 
 
 		 847 aa  240  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  36.08 
 
 		 930 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  39.76 
 
 		 867 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  41.69 
 
 		 837 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  36.67 
 
 		 940 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  36.21 
 
 		 866 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  37.08 
 
 		 954 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  38 
 
 		 866 aa  234  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  40.1 
 
 		 847 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  40.54 
 
 		 840 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  38.3 
 
 		 846 aa  233  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  37.84 
 
 		 843 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  42.07 
 
 		 846 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  37.44 
 
 		 834 aa  231  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  39.86 
 
 		 303 aa  230  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  38.81 
 
 		 837 aa  231  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  40.34 
 
 		 868 aa  230  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  40.34 
 
 		 868 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  36.32 
 
 		 813 aa  229  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  36.97 
 
 		 914 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  33.19 
 
 		 902 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  37.74 
 
 		 936 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  34.86 
 
 		 861 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  37.53 
 
 		 936 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  36.65 
 
 		 818 aa  225  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  39.05 
 
 		 927 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  37.93 
 
 		 932 aa  217  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  37.9 
 
 		 949 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  39.8 
 
 		 825 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.37 
 
 		 299 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  37.84 
 
 		 845 aa  214  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  37.53 
 
 		 927 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  40.33 
 
 		 825 aa  213  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  32.84 
 
 		 914 aa  208  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  33.45 
 
 		 646 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  37.35 
 
 		 837 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  38.83 
 
 		 306 aa  204  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  41.64 
 
 		 328 aa  197  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  49.76 
 
 		 608 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  38.49 
 
 		 314 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  31.97 
 
 		 313 aa  191  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  47.89 
 
 		 544 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.51 
 
 		 495 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  52.04 
 
 		 603 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  33.46 
 
 		 303 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  55.68 
 
 		 1001 aa  180  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  58.9 
 
 		 939 aa  178  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  35.96 
 
 		 312 aa  178  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.93 
 
 		 797 aa  177  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6783  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  37.91 
 
 		 292 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  34.98 
 
 		 831 aa  177  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2179  hypothetical protein  50.5 
 
 		 197 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.930875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  33.25 
 
 		 763 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2225  DNA ligase  49.04 
 
 		 213 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  38.58 
 
 		 292 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  33.09 
 
 		 477 aa  170  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5875  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.43 
 
 		 297 aa  170  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  34.18 
 
 		 852 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  33.67 
 
 		 759 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  40.33 
 
 		 815 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>