More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0884 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  87.5 
 
 		 789 aa  1076    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0884  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 726 aa  1375    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.911309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0932  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  88.07 
 
 		 737 aa  1086    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  67.94 
 
 		 847 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  49.37 
 
 		 896 aa  297  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  42.65 
 
 		 871 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  38.94 
 
 		 900 aa  261  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  40.34 
 
 		 872 aa  260  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  42.33 
 
 		 882 aa  257  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  39.41 
 
 		 882 aa  258  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  41.58 
 
 		 832 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  41.21 
 
 		 833 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  38.44 
 
 		 881 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  40.25 
 
 		 833 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  38.44 
 
 		 883 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  39.23 
 
 		 534 aa  249  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  37.95 
 
 		 895 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  38.43 
 
 		 911 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  38.01 
 
 		 893 aa  249  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  40.62 
 
 		 901 aa  248  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  38.81 
 
 		 845 aa  246  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  39.51 
 
 		 864 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  40 
 
 		 833 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  38.41 
 
 		 856 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  39.86 
 
 		 888 aa  242  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  41.35 
 
 		 822 aa  241  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  34.12 
 
 		 896 aa  241  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  34.32 
 
 		 877 aa  241  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  36.23 
 
 		 853 aa  240  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  37.78 
 
 		 913 aa  240  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  40.82 
 
 		 863 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  35.51 
 
 		 855 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  36.23 
 
 		 930 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  38.53 
 
 		 886 aa  238  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  40.58 
 
 		 867 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  38.59 
 
 		 918 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  38.26 
 
 		 848 aa  236  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  39.13 
 
 		 817 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  36.79 
 
 		 866 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  37.93 
 
 		 914 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  33.33 
 
 		 902 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  37.74 
 
 		 865 aa  233  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  40.05 
 
 		 847 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  38.77 
 
 		 851 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  40.25 
 
 		 871 aa  231  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  33.5 
 
 		 815 aa  231  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  40.85 
 
 		 837 aa  230  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  36.47 
 
 		 866 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  40.25 
 
 		 840 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  37.29 
 
 		 847 aa  228  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  38.29 
 
 		 837 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  38.5 
 
 		 936 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  35.68 
 
 		 861 aa  224  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  38.27 
 
 		 936 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  37.12 
 
 		 940 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  39.04 
 
 		 846 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  37.67 
 
 		 843 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  39.8 
 
 		 825 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  37.17 
 
 		 954 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  39.59 
 
 		 927 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  40.49 
 
 		 825 aa  217  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  38.28 
 
 		 303 aa  218  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  39.9 
 
 		 868 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  39.65 
 
 		 868 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  36.27 
 
 		 834 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  36.11 
 
 		 813 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  39.29 
 
 		 932 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  39.37 
 
 		 949 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  32.53 
 
 		 646 aa  211  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  39.8 
 
 		 927 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  37.3 
 
 		 845 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  36.52 
 
 		 818 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  40.21 
 
 		 306 aa  208  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  33.26 
 
 		 914 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.15 
 
 		 299 aa  207  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  40.35 
 
 		 846 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  38.13 
 
 		 837 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  39.66 
 
 		 314 aa  198  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  49.75 
 
 		 608 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  39.38 
 
 		 328 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  33.62 
 
 		 1001 aa  185  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  48.53 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  31.25 
 
 		 313 aa  179  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  36.81 
 
 		 312 aa  179  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  52.38 
 
 		 603 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  60.13 
 
 		 939 aa  174  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.84 
 
 		 797 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2225  DNA ligase  49 
 
 		 213 aa  170  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  39.18 
 
 		 414 aa  169  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  37.78 
 
 		 334 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  39.1 
 
 		 292 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.31 
 
 		 495 aa  167  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  30.27 
 
 		 303 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  38.81 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  38.29 
 
 		 339 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7781  putative DNA ligase-like protein  35.5 
 
 		 317 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711104  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  31.91 
 
 		 763 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2179  hypothetical protein  49.47 
 
 		 197 aa  162  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.930875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.58 
 
 		 302 aa  160  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  33.25 
 
 		 852 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>