More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0866 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  100 
 
 		 775 aa  1556    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  61.64 
 
 		 733 aa  860    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  99.23 
 
 		 775 aa  1546    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  70 
 
 		 766 aa  993    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  36.47 
 
 		 745 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  35.64 
 
 		 763 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  30.65 
 
 		 819 aa  306  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  32.99 
 
 		 681 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 829 aa  299  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  31.22 
 
 		 773 aa  296  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  31.05 
 
 		 751 aa  282  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  31.46 
 
 		 780 aa  280  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  31.53 
 
 		 774 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  29.38 
 
 		 720 aa  271  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  30.66 
 
 		 767 aa  267  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  43.68 
 
 		 776 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  28.9 
 
 		 803 aa  250  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  28.63 
 
 		 801 aa  243  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  28.16 
 
 		 772 aa  233  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  27.95 
 
 		 686 aa  211  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  38.29 
 
 		 833 aa  185  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  26.25 
 
 		 641 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  27.44 
 
 		 783 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  23.94 
 
 		 696 aa  168  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  32.62 
 
 		 794 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  27.66 
 
 		 793 aa  162  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  25.74 
 
 		 789 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  31.07 
 
 		 751 aa  159  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  33.55 
 
 		 756 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  31.97 
 
 		 793 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  26.1 
 
 		 807 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  24.96 
 
 		 752 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  26.43 
 
 		 803 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  24.25 
 
 		 787 aa  148  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.42 
 
 		 738 aa  148  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  33.76 
 
 		 805 aa  147  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  26.76 
 
 		 728 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  30.52 
 
 		 716 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  23.06 
 
 		 711 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  23.75 
 
 		 747 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  25.93 
 
 		 753 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  27.7 
 
 		 799 aa  140  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  28.29 
 
 		 660 aa  140  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  23.6 
 
 		 654 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  23.46 
 
 		 654 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.86 
 
 		 750 aa  135  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  23.62 
 
 		 650 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  32.26 
 
 		 797 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  25.79 
 
 		 717 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  29.31 
 
 		 640 aa  132  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  27.11 
 
 		 783 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  24.32 
 
 		 703 aa  132  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  29.31 
 
 		 640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  25.14 
 
 		 682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  23.65 
 
 		 736 aa  128  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  24.76 
 
 		 696 aa  127  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 640 aa  127  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 640 aa  127  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  28.4 
 
 		 714 aa  127  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  24.86 
 
 		 791 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 640 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  29.01 
 
 		 655 aa  125  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  31.87 
 
 		 697 aa  125  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  29.81 
 
 		 779 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  28.78 
 
 		 784 aa  124  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  24.71 
 
 		 791 aa  124  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  24.74 
 
 		 748 aa  123  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  28.77 
 
 		 681 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  27.6 
 
 		 635 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  28.03 
 
 		 686 aa  121  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  28.03 
 
 		 686 aa  121  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  28.03 
 
 		 686 aa  121  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  28.03 
 
 		 686 aa  120  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  28.48 
 
 		 805 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  30.29 
 
 		 667 aa  120  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.15 
 
 		 804 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  28.69 
 
 		 689 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  27.75 
 
 		 686 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  29.49 
 
 		 812 aa  118  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  27.69 
 
 		 714 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  27.72 
 
 		 776 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  28.81 
 
 		 657 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  29.14 
 
 		 803 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  26.92 
 
 		 630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  28.41 
 
 		 710 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  27 
 
 		 675 aa  115  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  28.18 
 
 		 781 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  26.24 
 
 		 658 aa  114  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  26.91 
 
 		 915 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  30.33 
 
 		 706 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.71 
 
 		 662 aa  114  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  29.48 
 
 		 704 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  22.88 
 
 		 733 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  29.14 
 
 		 803 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  27.88 
 
 		 781 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  27.93 
 
 		 670 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  30.15 
 
 		 705 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  23.11 
 
 		 636 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  29.05 
 
 		 700 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  29.05 
 
 		 700 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>