More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001979 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  74.73 
 
 		 194 aa  298  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 198 aa  256  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 199 aa  234  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 202 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  37.77 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  42.65 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  37.84 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  26.21 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  33.71 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  28.89 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5422  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  36.96 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 438 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>