295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1424 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  100 
 
 		 374 aa  749    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  48.83 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  49.86 
 
 		 688 aa  321  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  50.29 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  50.59 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  48.99 
 
 		 689 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  45.29 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  44.61 
 
 		 358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  42.12 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  43.75 
 
 		 369 aa  269  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  42.35 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  39.03 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  37.36 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  36.31 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  38.38 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  40.74 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  38.3 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  37.11 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  35.23 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  35.25 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.37 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  33.52 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  38.15 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  34.57 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  33.33 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  36.64 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  35.42 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  34.66 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  34.59 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  34.04 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  34.64 
 
 		 401 aa  192  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  32.81 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  34.34 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  33.68 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  35.28 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  35.58 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  33.13 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  32.17 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  31.65 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  34.01 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  33.53 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  33.23 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  32.33 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  32.33 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  29.65 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29.55 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  31.34 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  29.25 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  31.02 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  30.03 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 371 aa  96.7  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.11 
 
 		 426 aa  89.7  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.79 
 
 		 427 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  23.95 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.21 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  23.54 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.3 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  24.46 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  30.98 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  26.63 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.27 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.81 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.33 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  26.89 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.38 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  23.66 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  22.92 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  24.24 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  25.33 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  24.52 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  23.78 
 
 		 483 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  22.88 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  23.63 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.15 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.31 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.15 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>