More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8631 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 287 aa  567  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  38.24 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  41.75 
 
 		 158 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  35 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  44.95 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 195 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 137 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 159 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  34.07 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 157 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.53 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  34.07 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 157 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  31.68 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 141 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  34.69 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  34.02 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.36 
 
 		 156 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 150 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 142 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 174 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  29.05 
 
 		 160 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 172 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 170 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 158 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  34.04 
 
 		 168 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 147 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.43 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  31.78 
 
 		 152 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 153 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 161 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 166 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 157 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>