112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5090 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  100 
 
 
274 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  73.45 
 
 
274 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  54.28 
 
 
276 aa  251  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  44.49 
 
 
288 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  43.98 
 
 
275 aa  188  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  44.81 
 
 
279 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  39.62 
 
 
267 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  50.68 
 
 
484 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  36.5 
 
 
279 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  63.46 
 
 
472 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  43.1 
 
 
804 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  46.01 
 
 
506 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  37.23 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  47.06 
 
 
156 aa  135  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  62.75 
 
 
485 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  54.46 
 
 
156 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  53.92 
 
 
668 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  51.96 
 
 
150 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  52.69 
 
 
143 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  48.11 
 
 
230 aa  106  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  49 
 
 
604 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  55.21 
 
 
489 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  34.64 
 
 
413 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  38.17 
 
 
438 aa  94.4  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  46.6 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  42.39 
 
 
379 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  36.72 
 
 
172 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  29.15 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  37.19 
 
 
325 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  42.86 
 
 
222 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  46.15 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  32.99 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  35.9 
 
 
145 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  31.54 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  35.96 
 
 
583 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  47.83 
 
 
446 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  38.1 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  34.62 
 
 
447 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  30 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  40.26 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  33.72 
 
 
122 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  25.95 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2309  hypothetical protein  57.14 
 
 
174 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.42 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  35.53 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4087  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  36.36 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  35.23 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  36 
 
 
332 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  30 
 
 
212 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  35.23 
 
 
229 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  35.23 
 
 
229 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  35.23 
 
 
248 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  35.23 
 
 
246 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  35.23 
 
 
246 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  35.23 
 
 
246 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  34.07 
 
 
261 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  36.84 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13313  TonB  30.12 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  31.25 
 
 
467 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  34.18 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  38.27 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  30.26 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  33.33 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  33.33 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  33.33 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  33.33 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  37.66 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  29.41 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  34.62 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  33.33 
 
 
271 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.4 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.77 
 
 
112 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  33.33 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  33.33 
 
 
233 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  32.22 
 
 
295 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  32.47 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  25.44 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  33.33 
 
 
319 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  34.62 
 
 
227 aa  45.4  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  36.84 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  40.74 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  33.33 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  30.67 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  30.67 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  33.33 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  34.67 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  33.68 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  46.43 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  36.84 
 
 
342 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  31.25 
 
 
368 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  25.19 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  30.67 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  30.67 
 
 
226 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  32.56 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  30.77 
 
 
212 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  29.11 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  29.11 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  30.99 
 
 
150 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>