More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0046 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
432 aa  882    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  37.59 
 
 
427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 
412 aa  220  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  42.01 
 
 
517 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  38.79 
 
 
670 aa  149  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 
704 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  35.93 
 
 
694 aa  146  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 
525 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.78 
 
 
537 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  36.32 
 
 
658 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 
673 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  36.7 
 
 
510 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 
630 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  33.81 
 
 
641 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33.02 
 
 
669 aa  124  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.56 
 
 
640 aa  123  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  32.55 
 
 
620 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.9 
 
 
631 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  30.46 
 
 
509 aa  117  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  33.94 
 
 
1313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  33.48 
 
 
631 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  42.4 
 
 
505 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  42.74 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 
671 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  32.55 
 
 
656 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.2 
 
 
673 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0081  hypothetical protein  38.93 
 
 
184 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0519356  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 
306 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  32.44 
 
 
464 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  31.8 
 
 
645 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  48.65 
 
 
361 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 
374 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 
586 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  31.84 
 
 
638 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.06 
 
 
320 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  45.05 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  29.77 
 
 
679 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  31.76 
 
 
668 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 
241 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  31.98 
 
 
648 aa  93.6  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  40.16 
 
 
594 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  27.36 
 
 
734 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 
813 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  33.33 
 
 
626 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 
1755 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.42 
 
 
710 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
440 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
449 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.78 
 
 
707 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  40 
 
 
533 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 
193 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 
677 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  40 
 
 
533 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 
440 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  29.78 
 
 
643 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 
637 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  36.3 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 
507 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  28.14 
 
 
757 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 
613 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 
623 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.65 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  27.51 
 
 
660 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  37.07 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  30.53 
 
 
630 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  36.3 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  36.15 
 
 
650 aa  80.5  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.61 
 
 
712 aa  80.5  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.86 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 
1026 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  42.53 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
653 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.6 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 
296 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.89 
 
 
478 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 
210 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  30.81 
 
 
239 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
270 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  28.64 
 
 
642 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  36.97 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.11 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.5 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0605  OmpA/MotB domain protein  32.42 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583916  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  30.06 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 
175 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.45 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 
543 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>