More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1111 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  100 
 
 		 329 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  36.88 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  33.56 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  30.22 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  30.22 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3153  hypothetical protein  54.76 
 
 		 101 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.31 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  27.94 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  27.14 
 
 		 387 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  26.77 
 
 		 387 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  27.6 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  27.15 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  25.5 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  25.5 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  29.36 
 
 		 386 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  31.64 
 
 		 402 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  35.42 
 
 		 159 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  32.08 
 
 		 172 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  29.22 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  25.09 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  25.41 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  25.72 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  25.72 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  28.16 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  25.87 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.15 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  30.24 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  28.32 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  26.38 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  24.82 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  24.15 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  26.79 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  27.23 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  26.54 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.85 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.37 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25.83 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.74 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  25.69 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  23.1 
 
 		 467 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  23.85 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  26.38 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.59 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.02 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.57 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  26.42 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.4 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.21 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  24.48 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  24.48 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  31.25 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  24.48 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  24.55 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  24.55 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  24.55 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  24.55 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  24.48 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  23.91 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  26.72 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  25.48 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  23.45 
 
 		 444 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  33.11 
 
 		 571 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  26.12 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  27.89 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  27.42 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  23.41 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  26.63 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  31.21 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  24.47 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  27.97 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.68 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.08 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  25 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1213  ferredoxin, 4Fe-4S  23.55 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  24.15 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  24.51 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  22.98 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  25 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  23.53 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  23.73 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.68 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  23.73 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.53 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.69 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  23.13 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.86 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  26.8 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  24.49 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  23.56 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  23.67 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  22.22 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>