More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0873 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 193 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 234 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  49.3 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  27.23 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
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NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
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NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
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NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  45.83 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  45.83 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  41.79 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 283 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
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NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  51.92 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
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NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
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NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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