More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4025 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  69.67 
 
 		 1454 aa  1842    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  100 
 
 		 1523 aa  2999    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  46.79 
 
 		 1868 aa  606  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  53.36 
 
 		 696 aa  599  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  44.05 
 
 		 1652 aa  599  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  43.44 
 
 		 1363 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  45.92 
 
 		 1510 aa  575  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  46.14 
 
 		 1236 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  46.63 
 
 		 1553 aa  563  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  42.88 
 
 		 1163 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  45.86 
 
 		 1364 aa  548  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  48.89 
 
 		 1789 aa  546  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  51.81 
 
 		 1656 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.13 
 
 		 1481 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  37.14 
 
 		 1280 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  38.9 
 
 		 947 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  36.05 
 
 		 1831 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.47 
 
 		 1686 aa  520  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.96 
 
 		 1557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  40.34 
 
 		 1193 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 1221 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  37.61 
 
 		 1474 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  36.49 
 
 		 1367 aa  486  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  36.5 
 
 		 1484 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  39.62 
 
 		 728 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  38.66 
 
 		 1188 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  37.35 
 
 		 1196 aa  473  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.73 
 
 		 1711 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.92 
 
 		 1760 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  37.6 
 
 		 1190 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  37.13 
 
 		 1247 aa  450  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  39.78 
 
 		 1416 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  40.55 
 
 		 1443 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  40.95 
 
 		 1661 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  43.62 
 
 		 919 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  35.26 
 
 		 1858 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.94 
 
 		 1598 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.59 
 
 		 930 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  43.45 
 
 		 1714 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.73 
 
 		 1856 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  43.27 
 
 		 1357 aa  425  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  42.7 
 
 		 1211 aa  423  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1229 aa  423  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  35.38 
 
 		 1213 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.29 
 
 		 1583 aa  416  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  37.18 
 
 		 1552 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.86 
 
 		 1262 aa  413  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.42 
 
 		 1609 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  36.32 
 
 		 1901 aa  407  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  38.12 
 
 		 1176 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.86 
 
 		 1684 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  41.64 
 
 		 1217 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.98 
 
 		 1547 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.97 
 
 		 1626 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  34.74 
 
 		 1807 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  38.72 
 
 		 1177 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  32.79 
 
 		 1208 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.93 
 
 		 1607 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  38.51 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  32.93 
 
 		 1330 aa  373  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31.68 
 
 		 1242 aa  370  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.4 
 
 		 1348 aa  364  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  35.14 
 
 		 1214 aa  363  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.62 
 
 		 1599 aa  362  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 		 1188 aa  357  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.74 
 
 		 1617 aa  351  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  30.02 
 
 		 1427 aa  350  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  34.33 
 
 		 1373 aa  348  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  37.54 
 
 		 608 aa  336  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  32.82 
 
 		 1161 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.62 
 
 		 924 aa  334  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  32.82 
 
 		 1161 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.78 
 
 		 1267 aa  333  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  46.38 
 
 		 1599 aa  329  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  33.45 
 
 		 1164 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  38.12 
 
 		 1766 aa  326  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.73 
 
 		 1623 aa  323  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  34 
 
 		 1311 aa  320  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  43.94 
 
 		 1878 aa  311  6.999999999999999e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  34.43 
 
 		 1209 aa  311  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.3 
 
 		 1823 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  34.88 
 
 		 1344 aa  308  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  35.53 
 
 		 1491 aa  307  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  36.67 
 
 		 565 aa  303  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1209 aa  303  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  30.24 
 
 		 1016 aa  303  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.74 
 
 		 1205 aa  302  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.24 
 
 		 1304 aa  302  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  30.91 
 
 		 1411 aa  301  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.79 
 
 		 1240 aa  301  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.14 
 
 		 677 aa  300  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.94 
 
 		 1016 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  33.07 
 
 		 969 aa  299  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  44.14 
 
 		 344 aa  299  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  44.21 
 
 		 344 aa  294  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.39 
 
 		 1004 aa  288  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  40.07 
 
 		 589 aa  286  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.9 
 
 		 676 aa  286  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  35.05 
 
 		 1100 aa  277  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1097 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>