163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0327 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  93.15 
 
 
657 aa  1270    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1370    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  42.88 
 
 
624 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  45.89 
 
 
582 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  45.41 
 
 
566 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  45.03 
 
 
588 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  37.4 
 
 
637 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  42.46 
 
 
633 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  41.8 
 
 
630 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  42.82 
 
 
4489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  41.59 
 
 
632 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  40.36 
 
 
1094 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  41.58 
 
 
3560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  41.95 
 
 
1085 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  39.27 
 
 
654 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  40.31 
 
 
3035 aa  283  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  43.51 
 
 
740 aa  283  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 
618 aa  280  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 
700 aa  279  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  38.93 
 
 
761 aa  273  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 
732 aa  270  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  41.85 
 
 
611 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 
574 aa  267  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  38.69 
 
 
492 aa  264  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 
569 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  39.07 
 
 
459 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 
672 aa  257  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  35.75 
 
 
560 aa  249  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 
647 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  39.79 
 
 
452 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
616 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  37.99 
 
 
667 aa  247  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  36.91 
 
 
395 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
750 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 
909 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  33.91 
 
 
816 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
660 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
632 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  37.12 
 
 
590 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  36.84 
 
 
590 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
739 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 
750 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.86 
 
 
589 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 
295 aa  207  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  29.93 
 
 
594 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  29.4 
 
 
568 aa  204  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  32.39 
 
 
680 aa  203  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 
706 aa  200  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 
570 aa  201  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
808 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.79 
 
 
589 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
1714 aa  193  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.52 
 
 
1106 aa  190  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
633 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 
667 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
789 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
1106 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.69 
 
 
529 aa  177  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
647 aa  177  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
619 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
968 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
598 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.65 
 
 
585 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
633 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 
828 aa  170  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
754 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
789 aa  167  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
754 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
739 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 
833 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 
833 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.1 
 
 
745 aa  164  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  32.88 
 
 
552 aa  164  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  30.39 
 
 
719 aa  163  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
595 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
708 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
627 aa  161  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.75 
 
 
699 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
739 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 
828 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
734 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  29.38 
 
 
747 aa  157  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  27.32 
 
 
596 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  30.05 
 
 
731 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  30.05 
 
 
731 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
828 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
717 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
732 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
717 aa  153  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
626 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0113  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.44 
 
 
726 aa  152  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0423432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  29.13 
 
 
740 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
718 aa  150  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  27.46 
 
 
937 aa  150  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 
776 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  27.61 
 
 
1221 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
824 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.2 
 
 
796 aa  146  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  27.51 
 
 
821 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 
821 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>