205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1358 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 646 aa  1296    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  62.96 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  54.15 
 
 		 1051 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  44.55 
 
 		 303 aa  277  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  51.98 
 
 		 2296 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  48.31 
 
 		 963 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  43.39 
 
 		 1030 aa  238  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41 
 
 		 1130 aa  220  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  40.83 
 
 		 1351 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  41.72 
 
 		 1750 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  43.81 
 
 		 1026 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.31 
 
 		 1292 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 		 892 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  40.82 
 
 		 831 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  36.71 
 
 		 652 aa  180  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 		 850 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 		 772 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1763 aa  166  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.47 
 
 		 693 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  34.06 
 
 		 930 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  36.88 
 
 		 709 aa  154  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  34.88 
 
 		 676 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  34.78 
 
 		 387 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  39.08 
 
 		 1079 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  35.43 
 
 		 668 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  34.17 
 
 		 627 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  41.87 
 
 		 346 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  35 
 
 		 390 aa  143  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  36.3 
 
 		 391 aa  142  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  37.37 
 
 		 522 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 		 863 aa  138  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  34.39 
 
 		 359 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  34.34 
 
 		 579 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  37.13 
 
 		 1046 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  33.97 
 
 		 623 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 		 343 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  37.61 
 
 		 2831 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  35.34 
 
 		 930 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  32.78 
 
 		 392 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  37.6 
 
 		 752 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  28.61 
 
 		 504 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  34.56 
 
 		 404 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  33.12 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 732 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  26.79 
 
 		 328 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  36.09 
 
 		 460 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 2961 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  31.63 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  30.17 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  32.25 
 
 		 841 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.47 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.61 
 
 		 1293 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  29.34 
 
 		 425 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  30.91 
 
 		 1030 aa  100  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 719 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 770 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 503 aa  99  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1163 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  29.09 
 
 		 448 aa  96.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.82 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  29.96 
 
 		 786 aa  94.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  34.23 
 
 		 487 aa  94.7  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  28.81 
 
 		 805 aa  94.4  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  31.75 
 
 		 672 aa  94  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.64 
 
 		 1146 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.58 
 
 		 2350 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 807 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  48.96 
 
 		 652 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 		 639 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  32.2 
 
 		 498 aa  88.6  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 756 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  29.52 
 
 		 1916 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  27.41 
 
 		 581 aa  85.9  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.49 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  38.38 
 
 		 1675 aa  83.2  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.1 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35.18 
 
 		 1140 aa  80.5  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  29.2 
 
 		 470 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  31.21 
 
 		 674 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  40.21 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  25.98 
 
 		 699 aa  76.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.6 
 
 		 641 aa  75.1  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.74 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  25.14 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  25.32 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  30.96 
 
 		 664 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  37.61 
 
 		 929 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  27.82 
 
 		 355 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  36.36 
 
 		 1118 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  24.83 
 
 		 711 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 319 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  25.75 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  39.13 
 
 		 1327 aa  68.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  29.47 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  23.68 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  34.33 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  31.69 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  40.45 
 
 		 1138 aa  68.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1177 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  26.64 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>