194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03554 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  42.58 
 
 
1672 aa  692    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.7 
 
 
1673 aa  673    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  100 
 
 
1222 aa  2357    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  43.53 
 
 
1232 aa  276  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  42.13 
 
 
1879 aa  221  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  38.83 
 
 
3911 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.76 
 
 
692 aa  140  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  32.03 
 
 
3544 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  36.87 
 
 
3542 aa  131  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  49.46 
 
 
1394 aa  130  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.76 
 
 
3699 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.24 
 
 
3699 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  34.2 
 
 
683 aa  115  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.47 
 
 
1272 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  37.28 
 
 
1626 aa  100  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  28.35 
 
 
2402 aa  98.6  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  32.23 
 
 
1544 aa  95.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  34.31 
 
 
813 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.97 
 
 
11716 aa  89.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  39.56 
 
 
4013 aa  88.6  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  27.75 
 
 
1597 aa  87.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  32.44 
 
 
4231 aa  84.7  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  28.76 
 
 
3563 aa  83.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.49 
 
 
2522 aa  82  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  39.49 
 
 
409 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.96 
 
 
1180 aa  79  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.72 
 
 
1779 aa  78.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  21.4 
 
 
1214 aa  78.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  34.65 
 
 
1037 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  33.02 
 
 
2310 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.18 
 
 
2305 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.84 
 
 
887 aa  76.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.89 
 
 
1800 aa  75.5  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  47.56 
 
 
618 aa  75.5  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  27.14 
 
 
664 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  31.78 
 
 
2079 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.75 
 
 
3477 aa  71.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.37 
 
 
1661 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.43 
 
 
3474 aa  70.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  27.27 
 
 
594 aa  70.1  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  36 
 
 
1170 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  30.57 
 
 
1598 aa  68.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  35.74 
 
 
8321 aa  68.6  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.89 
 
 
3168 aa  68.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  52.78 
 
 
891 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.07 
 
 
1369 aa  67  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.72 
 
 
1884 aa  67  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.71 
 
 
641 aa  66.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  32.06 
 
 
3244 aa  66.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44 
 
 
878 aa  65.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  31.4 
 
 
1029 aa  65.1  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  43.82 
 
 
2375 aa  65.1  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  28.69 
 
 
892 aa  65.1  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  24.58 
 
 
2848 aa  63.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  28.31 
 
 
2476 aa  63.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.9 
 
 
3598 aa  63.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  28.45 
 
 
1886 aa  63.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.22 
 
 
1340 aa  62.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  43.68 
 
 
471 aa  62.4  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  25.35 
 
 
4848 aa  62.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  41.86 
 
 
1123 aa  62.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.92 
 
 
1029 aa  62  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  37.36 
 
 
731 aa  62  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.32 
 
 
2194 aa  61.6  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  40.74 
 
 
1269 aa  61.6  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  41.38 
 
 
2816 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.45 
 
 
928 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.24 
 
 
761 aa  60.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  32.07 
 
 
2503 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  27.71 
 
 
662 aa  60.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.26 
 
 
774 aa  59.7  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.84 
 
 
1222 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  23.86 
 
 
1012 aa  59.3  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4557  putative Ig  37.8 
 
 
926 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0762461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  36.43 
 
 
1129 aa  59.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  24.44 
 
 
597 aa  59.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  24 
 
 
684 aa  58.9  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  27.97 
 
 
4465 aa  59.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  40.15 
 
 
1268 aa  58.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.46 
 
 
1009 aa  58.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1308  hypothetical protein  36.47 
 
 
414 aa  58.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  29.25 
 
 
5899 aa  57.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  24.06 
 
 
597 aa  58.2  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  27.48 
 
 
1911 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  28.51 
 
 
814 aa  57.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2831  Ig family protein  38.46 
 
 
443 aa  57.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  0.161271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.67 
 
 
1225 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  39.39 
 
 
1269 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 
2083 aa  56.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  27.15 
 
 
3089 aa  56.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.72 
 
 
889 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25 
 
 
891 aa  55.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  35.15 
 
 
857 aa  55.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.52 
 
 
3396 aa  55.5  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.78 
 
 
2346 aa  55.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  25.1 
 
 
646 aa  55.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.64 
 
 
1113 aa  55.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.51 
 
 
4220 aa  55.1  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  35.29 
 
 
311 aa  55.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0172  hypothetical protein  33.9 
 
 
398 aa  55.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>