More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2496 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  100 
 
 
472 aa  941  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  85.53 
 
 
477 aa  808  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  93.01 
 
 
472 aa  873  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  66.67 
 
 
471 aa  584  1e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  62.58 
 
 
472 aa  577  1e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  61.8 
 
 
472 aa  561  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  53.66 
 
 
477 aa  506  1e-142  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  53.83 
 
 
472 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  52.77 
 
 
475 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  52.65 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  52.77 
 
 
475 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  54.35 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  54.35 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  53.9 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  53.03 
 
 
472 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  54.35 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  54.13 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  52.03 
 
 
472 aa  467  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  52.03 
 
 
472 aa  467  1e-130  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  52.03 
 
 
472 aa  467  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  50.85 
 
 
488 aa  466  1e-130  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  52.42 
 
 
492 aa  460  1e-128  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  51.53 
 
 
487 aa  459  1e-128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  50.44 
 
 
482 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  51.54 
 
 
488 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  50.54 
 
 
487 aa  453  1e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  50.75 
 
 
487 aa  454  1e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 
494 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  46.98 
 
 
479 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 
479 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  47.03 
 
 
479 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  51.56 
 
 
469 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  45.66 
 
 
479 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  54.29 
 
 
494 aa  407  1e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  47.38 
 
 
479 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  47.51 
 
 
465 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  41.58 
 
 
471 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 
471 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  46.25 
 
 
473 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  42.48 
 
 
475 aa  340  3e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  37.55 
 
 
466 aa  315  1e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
458 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
456 aa  250  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  31.73 
 
 
448 aa  229  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  31.18 
 
 
485 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  30.11 
 
 
487 aa  226  5e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.33 
 
 
485 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
448 aa  221  2e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  30.9 
 
 
485 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.67 
 
 
464 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.67 
 
 
487 aa  216  6e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.67 
 
 
487 aa  216  6e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.45 
 
 
487 aa  215  2e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.16 
 
 
470 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  30.49 
 
 
467 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.84 
 
 
450 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.5 
 
 
461 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  31.52 
 
 
474 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.41 
 
 
462 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
451 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
451 aa  185  1e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  27.97 
 
 
462 aa  184  4e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.79 
 
 
478 aa  183  5e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.22 
 
 
462 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  1.09951e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.19 
 
 
474 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.44 
 
 
474 aa  183  8e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.44 
 
 
473 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  30.57 
 
 
478 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.57 
 
 
478 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  30.57 
 
 
478 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  30.57 
 
 
478 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  30.94 
 
 
474 aa  180  5e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.35 
 
 
478 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  30.35 
 
 
478 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.62 
 
 
459 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.05 
 
 
474 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.73666e-10  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  29.27 
 
 
477 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.48 
 
 
455 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.82 
 
 
455 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.2 
 
 
462 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.07 
 
 
472 aa  174  4e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  29.91 
 
 
468 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
473 aa  173  7e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.72 
 
 
476 aa  173  8e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
460 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.35 
 
 
468 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
472 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
462 aa  170  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.08 
 
 
473 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
466 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
459 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.25 
 
 
447 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.24 
 
 
474 aa  166  6e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  30.71 
 
 
430 aa  165  1e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
459 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
470 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
456 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.67 
 
 
457 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
470 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  28.19 
 
 
459 aa  157  5e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>