228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0041 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0041  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
460 aa  948  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 
427 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
415 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
424 aa  96.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
412 aa  82.8  1e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  21.1 
 
 
424 aa  79.3  1e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
430 aa  78.6  2e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 
412 aa  79  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
456 aa  77.8  4e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
432 aa  76.6  9e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 
421 aa  75.5  2e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
455 aa  74.3  5e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 
426 aa  73.9  6e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
399 aa  73.6  7e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 
423 aa  72.4  2e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 
413 aa  72  2e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
433 aa  70.5  6e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 
414 aa  70.5  6e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 
426 aa  68.2  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 
426 aa  68.2  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.13 
 
 
440 aa  66.6  8e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
488 aa  65.5  2e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 
440 aa  65.9  2e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
440 aa  65.1  3e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 
435 aa  65.1  3e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 
443 aa  65.1  3e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
488 aa  64.3  4e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.02 
 
 
430 aa  63.5  7e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.23 
 
 
430 aa  62  2e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 
430 aa  62  2e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  21.29 
 
 
428 aa  62  2e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 
446 aa  61.6  3e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.23 
 
 
430 aa  61.6  3e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 
430 aa  61.6  3e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  23.23 
 
 
430 aa  61.6  3e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.23 
 
 
430 aa  61.6  3e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 
433 aa  61.2  4e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
439 aa  60.8  5e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 
445 aa  60.8  5e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 
432 aa  60.8  5e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  19.96 
 
 
429 aa  60.5  6e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  21.25 
 
 
421 aa  60.5  7e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 
441 aa  60.1  8e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 
414 aa  59.7  9e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.22 
 
 
416 aa  59.3  1e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23 
 
 
432 aa  59.3  1e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
423 aa  59.7  1e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 
414 aa  59.7  1e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.1 
 
 
438 aa  59.3  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
427 aa  58.9  2e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2274  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 
1012 aa  58.9  2e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.16 
 
 
438 aa  58.2  3e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.93 
 
 
426 aa  58.2  3e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.2 
 
 
427 aa  58.2  3e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  23.55 
 
 
436 aa  58.2  3e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 
416 aa  57.8  4e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 
459 aa  57.8  4e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  20.86 
 
 
461 aa  57.4  5e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.58 
 
 
420 aa  57  6e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 
403 aa  56.2  1e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 
442 aa  56.2  1e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  19.9 
 
 
459 aa  56.2  1e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.24434e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
417 aa  55.8  1e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
452 aa  56.2  1e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  22.89 
 
 
409 aa  56.2  1e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
438 aa  56.2  1e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
420 aa  56.2  1e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
458 aa  55.1  2e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 
951 aa  55.5  2e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  20.33 
 
 
411 aa  55.5  2e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  21.18 
 
 
429 aa  55.8  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 
431 aa  55.1  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  21.04 
 
 
415 aa  55.1  3e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  20.06 
 
 
402 aa  54.7  3e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  32.17 
 
 
520 aa  54.7  3e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  4.30481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 
430 aa  54.7  3e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 
421 aa  55.1  3e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26.15 
 
 
437 aa  54.3  4e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
441 aa  54.3  4e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 
414 aa  54.3  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
430 aa  54.3  5e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.35 
 
 
430 aa  53.9  6e-06  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 
503 aa  53.9  6e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 
441 aa  53.9  6e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52964e-06 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 
447 aa  53.9  6e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.78 
 
 
431 aa  53.9  6e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
425 aa  52.8  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  20.88 
 
 
425 aa  52.8  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
422 aa  53.1  1e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 
428 aa  53.1  1e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 
433 aa  53.1  1e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  4.88029e-05  hitchhiker  1.84856e-05 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 
961 aa  52.8  1e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 
484 aa  52.8  1e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  1.08946e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
427 aa  52.8  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 
428 aa  52.8  1e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  20.86 
 
 
434 aa  53.1  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.32 
 
 
419 aa  52.4  2e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
431 aa  52.4  2e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 
425 aa  52  2e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 
453 aa  52.4  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>