More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0045 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 414 aa  844    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  71.74 
 
 		 415 aa  627  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  46.21 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.69 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.3 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  28.61 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.45 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.83 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 400 aa  107  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.38 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 421 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.34 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 464 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 403 aa  99.8  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 444 aa  99.8  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.8 
 
 		 410 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25.6 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 438 aa  96.3  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  27.32 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.52 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.52 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.44 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 441 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 437 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 437 aa  93.6  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 421 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 411 aa  93.2  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 444 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 435 aa  93.2  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 504 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 453 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 486 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.93 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.36 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 447 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.14 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.61 
 
 		 490 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>