80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2781 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  100 
 
 
2886 aa  5532    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  33.97 
 
 
2194 aa  775    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  38.99 
 
 
1359 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  37.86 
 
 
1699 aa  485  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.55 
 
 
4480 aa  445  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  44.97 
 
 
1902 aa  341  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  33.08 
 
 
4830 aa  293  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  32.55 
 
 
3864 aa  283  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  32.87 
 
 
7434 aa  282  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  31.61 
 
 
3066 aa  266  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.86 
 
 
5442 aa  246  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.87 
 
 
2156 aa  244  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.25 
 
 
3227 aa  228  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  29.31 
 
 
1895 aa  165  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  29.91 
 
 
1196 aa  141  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  30.34 
 
 
918 aa  127  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  32.94 
 
 
1184 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  29.63 
 
 
2233 aa  122  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  36.42 
 
 
852 aa  113  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  36.09 
 
 
2839 aa  104  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  30.52 
 
 
954 aa  101  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.65 
 
 
1879 aa  95.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.22 
 
 
1526 aa  92.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  35.95 
 
 
1092 aa  89.7  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  40.91 
 
 
1151 aa  87  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  31.28 
 
 
860 aa  85.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  47.75 
 
 
2715 aa  82.8  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  26.48 
 
 
2796 aa  82.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  22.27 
 
 
2552 aa  82  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  28.8 
 
 
1219 aa  81.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.78 
 
 
2768 aa  80.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  25.6 
 
 
3340 aa  79.7  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  29.37 
 
 
2690 aa  79.7  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  32.97 
 
 
4697 aa  78.2  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  29.19 
 
 
1695 aa  74.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  32.49 
 
 
790 aa  74.3  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  42.65 
 
 
3474 aa  73.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  30.39 
 
 
873 aa  73.6  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.45 
 
 
2927 aa  72.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  31.36 
 
 
819 aa  71.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  30.14 
 
 
607 aa  70.5  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  30.28 
 
 
781 aa  68.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  33.2 
 
 
562 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  35.53 
 
 
768 aa  67.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  27.56 
 
 
5171 aa  67  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  34.88 
 
 
3562 aa  66.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  27.58 
 
 
763 aa  65.9  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  24.11 
 
 
5745 aa  61.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  27.89 
 
 
1736 aa  59.7  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  27.23 
 
 
1428 aa  58.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  32.45 
 
 
756 aa  58.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.31 
 
 
1073 aa  58.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  31.48 
 
 
1047 aa  57  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  27.81 
 
 
764 aa  55.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  26.77 
 
 
846 aa  53.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  25.61 
 
 
3516 aa  52.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  29.49 
 
 
770 aa  52.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  30.65 
 
 
499 aa  52.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.14 
 
 
1661 aa  52  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  27.98 
 
 
2193 aa  50.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 
1096 aa  50.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  26.79 
 
 
1035 aa  49.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  38.55 
 
 
767 aa  49.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.09 
 
 
1332 aa  48.9  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  24.86 
 
 
2272 aa  49.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  28.76 
 
 
1657 aa  48.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  33.8 
 
 
693 aa  48.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.26 
 
 
1143 aa  48.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.78 
 
 
4106 aa  47.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  25.64 
 
 
2344 aa  48.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  31.18 
 
 
768 aa  48.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  29.09 
 
 
777 aa  47.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  27.94 
 
 
2239 aa  47.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  42.17 
 
 
759 aa  47  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3786  outer membrane autotransporter  21.74 
 
 
573 aa  47  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  30.48 
 
 
514 aa  47  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  31.62 
 
 
675 aa  47  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.69 
 
 
726 aa  46.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3641  hypothetical protein  32.98 
 
 
332 aa  46.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  25.68 
 
 
889 aa  46.2  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>