More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1574 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  100 
 
 
549 aa  1129    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  56.91 
 
 
546 aa  644    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  56.91 
 
 
546 aa  642    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  57.45 
 
 
546 aa  648    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  56.73 
 
 
546 aa  640    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  56.27 
 
 
547 aa  621  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  54.1 
 
 
543 aa  617  1e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  47.26 
 
 
557 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  48.63 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  46.08 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  46.63 
 
 
557 aa  512  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  45.37 
 
 
559 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  43.11 
 
 
617 aa  412  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  41.37 
 
 
604 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  40.35 
 
 
610 aa  402  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  41.81 
 
 
620 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  38.62 
 
 
622 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  39.47 
 
 
618 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  40.22 
 
 
512 aa  378  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  40.68 
 
 
513 aa  368  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  35.84 
 
 
547 aa  290  7e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  34.14 
 
 
609 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  35.06 
 
 
791 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  35.5 
 
 
797 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  38.64 
 
 
628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  37.18 
 
 
549 aa  272  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  32.93 
 
 
682 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  34.18 
 
 
545 aa  271  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  33 
 
 
749 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.79 
 
 
583 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  35.25 
 
 
671 aa  265  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  34.65 
 
 
551 aa  264  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  36.71 
 
 
640 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  31.3 
 
 
556 aa  261  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  32.3 
 
 
654 aa  259  8e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  36.13 
 
 
692 aa  256  7e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  37.34 
 
 
549 aa  256  8e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  34.9 
 
 
558 aa  256  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  33.02 
 
 
847 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  36.22 
 
 
831 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  33.4 
 
 
519 aa  251  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  34.32 
 
 
591 aa  246  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  31.78 
 
 
542 aa  246  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  35.71 
 
 
1255 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  38.84 
 
 
991 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  31.65 
 
 
722 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  35.97 
 
 
1335 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  35.71 
 
 
1319 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  33.63 
 
 
489 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.44 
 
 
491 aa  231  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  34.01 
 
 
770 aa  227  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.89 
 
 
492 aa  223  7e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  33.48 
 
 
492 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  35.26 
 
 
612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33.1 
 
 
577 aa  209  8e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  34.65 
 
 
572 aa  205  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32.49 
 
 
515 aa  181  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  34.22 
 
 
311 aa  177  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  31.46 
 
 
473 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  30 
 
 
463 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.08 
 
 
521 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
452 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  32.08 
 
 
453 aa  160  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  29.93 
 
 
552 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  31.67 
 
 
464 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  29.93 
 
 
548 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  30.41 
 
 
450 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  28.29 
 
 
476 aa  156  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  31.15 
 
 
444 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  29.6 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  32 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
452 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  29.27 
 
 
498 aa  154  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  31.77 
 
 
504 aa  153  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.18 
 
 
479 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  30.25 
 
 
463 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  29.18 
 
 
552 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30.81 
 
 
476 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31.86 
 
 
491 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  35.42 
 
 
624 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  32.4 
 
 
468 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  30.79 
 
 
485 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.07 
 
 
445 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  29.36 
 
 
462 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  32.15 
 
 
467 aa  150  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  28.75 
 
 
454 aa  150  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  31.79 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  29.97 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  29.78 
 
 
469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  30.39 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  30.65 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  30.65 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  32.47 
 
 
449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  29.74 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  30.65 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  29.74 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  29.45 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  32.07 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  29.45 
 
 
438 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>