122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0090 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0090  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 177 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247588  normal  0.0443693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1753  cyclic nucleotide-binding protein  34.76 
 
 		 357 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1134  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.65 
 
 		 364 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.081073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4022  cyclic nucleotide-binding protein  37.4 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1592  cyclic nucleotide-binding protein  33 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.65 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.86 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  33.57 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  27.64 
 
 		 357 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  37.21 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 480 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 		 449 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.56 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  27.64 
 
 		 739 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  28.46 
 
 		 747 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.57 
 
 		 246 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 229 aa  50.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  31.67 
 
 		 876 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  33.07 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.54 
 
 		 487 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 563 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0165  cyclic nucleotide-binding  33.65 
 
 		 124 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 492 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  33.86 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  33.02 
 
 		 417 aa  47.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.8 
 
 		 322 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  33.07 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2885  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  31.63 
 
 		 419 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 858 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  30.49 
 
 		 528 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  33.96 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  32.58 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  34.86 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  32.58 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.09 
 
 		 226 aa  45.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.94 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.01 
 
 		 425 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  33.01 
 
 		 425 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.86 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 231 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 266 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2760  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.378531  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4575  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 475 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.12 
 
 		 219 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 948 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.55 
 
 		 503 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  36.78 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.79 
 
 		 1075 aa  44.7  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0845  diguanylate cyclase  29.69 
 
 		 318 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  33.7 
 
 		 454 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 		 489 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.69 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  37.84 
 
 		 506 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1127  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.1 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.871772  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  28.79 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 		 493 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.76 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1996  cAMP-binding protein  32.95 
 
 		 1002 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2535  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187626  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4111  cyclic nucleotide-binding protein  35.82 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  34.48 
 
 		 441 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2527  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.122265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  30.95 
 
 		 620 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  34.23 
 
 		 577 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  32.11 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  25.78 
 
 		 721 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  25.58 
 
 		 721 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  28.89 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  35.59 
 
 		 868 aa  42.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  31.69 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 246 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3582  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 		 554 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0031716  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  32.32 
 
 		 238 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 637 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  32.11 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 179 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3563  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 312 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  32.32 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 		 594 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>