More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3494 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  98.27 
 
 
177 aa  349  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6054  cyclic nucleotide-binding protein  60.9 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507117  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  66.47 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  55.83 
 
 
163 aa  187  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5297  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.05 
 
 
154 aa  148  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4111  cyclic nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
163 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3813  cAMP-dependent protein kinase - catabolite gene activator and regulatory subunit  38.12 
 
 
172 aa  99  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0179  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  34.26 
 
 
563 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.67 
 
 
141 aa  61.6  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 
226 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
159 aa  58.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  32.35 
 
 
224 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.7 
 
 
146 aa  57.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.43 
 
 
225 aa  57.4  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  29.92 
 
 
747 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  31.78 
 
 
739 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  30.6 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.72 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 
238 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.29 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  32.17 
 
 
194 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
225 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
598 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 
149 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
225 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
212 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  29.51 
 
 
226 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.43 
 
 
225 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.91 
 
 
228 aa  54.3  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  36.28 
 
 
581 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.03 
 
 
242 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
234 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  28.83 
 
 
729 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 
577 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 
350 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 
242 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 
286 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  23.7 
 
 
212 aa  52  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.83 
 
 
232 aa  51.6  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 
425 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  30.84 
 
 
425 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.42 
 
 
322 aa  51.6  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  23.58 
 
 
721 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  28.21 
 
 
210 aa  51.2  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.23 
 
 
227 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.3 
 
 
226 aa  51.2  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 
227 aa  51.2  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  33 
 
 
225 aa  50.8  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  28.21 
 
 
210 aa  50.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  34.41 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.96 
 
 
209 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
222 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.34 
 
 
289 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.52 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
231 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
237 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  27.83 
 
 
734 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  29.06 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.17 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 
212 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  31.45 
 
 
1053 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  23.08 
 
 
721 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.91 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  39.29 
 
 
528 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.26 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.21 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  28.21 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  28.21 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  37.5 
 
 
749 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  28.21 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.96 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  35.14 
 
 
583 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  29.63 
 
 
214 aa  49.3  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  28.21 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
234 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  28.21 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  28.21 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  28.21 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  26.23 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  30.63 
 
 
198 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 
211 aa  48.5  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.83 
 
 
243 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2885  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
321 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  31.87 
 
 
412 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.95 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  27.35 
 
 
210 aa  48.5  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  33.66 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>