More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1573 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 158 aa  320  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  95.14 
 
 		 144 aa  277  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  70.89 
 
 		 157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  72.67 
 
 		 155 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  63.58 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.3 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.22 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  33.63 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1689  cyclic nucleotide-binding protein  29.23 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.71 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.86 
 
 		 228 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.66 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 238 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.45 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  34.19 
 
 		 415 aa  70.5  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  37.65 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.32 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  35.04 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.01 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0411  cyclic nucleotide-binding protein  31.15 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0173  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0419  cyclic nucleotide-binding protein  31.15 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 228 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  31.3 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.71 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  32.17 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.58 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.04 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 		 624 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.72 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0234  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.94 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0636  cyclic nucleotide-binding protein  30.33 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.7 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  26.23 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.1 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 247 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.14 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 252 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  38.89 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  32.46 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.89 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  34.26 
 
 		 435 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.23 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.3 
 
 		 1056 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.69 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.85 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  35.4 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 		 220 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.41 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  30.63 
 
 		 219 aa  60.5  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  27.13 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.46 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0116  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4053  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  29.91 
 
 		 747 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.12 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.39 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.17 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  31.86 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>