190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0411 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0411  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0419  cyclic nucleotide-binding protein  99.04 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0636  cyclic nucleotide-binding protein  83.49 
 
 		 212 aa  342  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1689  cyclic nucleotide-binding protein  69.19 
 
 		 212 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0277  cyclic nucleotide-binding protein  66.99 
 
 		 210 aa  275  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1067  cyclic nucleotide-binding protein  60 
 
 		 210 aa  221  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3761  cAMP-binding domain-containing protein  47.59 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.074854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  31.15 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  31.15 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  30.33 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  30.09 
 
 		 155 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.77 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  32.2 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0234  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.1 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.6 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.97 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  31 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.81 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  29.32 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  23.24 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.11 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  30.11 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  31.31 
 
 		 598 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.1 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0173  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.9 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0116  cyclic nucleotide-binding protein  31.07 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  26.98 
 
 		 860 aa  51.6  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.12 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  28.36 
 
 		 583 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.6 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2741  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.07 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 581 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 		 577 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  29 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.44 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.76 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.9 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.41 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 417 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  24 
 
 		 419 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  31.18 
 
 		 454 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  23.85 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4440  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 575 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0105368  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  29.91 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.42 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.37 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.66 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  26.83 
 
 		 582 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>